More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0078 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  100 
 
 
536 aa  1036    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  57.88 
 
 
513 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  54.31 
 
 
528 aa  519  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  53.55 
 
 
526 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  55.29 
 
 
524 aa  489  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  51.35 
 
 
518 aa  474  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  59.28 
 
 
481 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  52.23 
 
 
509 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  54.87 
 
 
558 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  53 
 
 
553 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  54.66 
 
 
517 aa  451  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  49.02 
 
 
562 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  54.97 
 
 
496 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  54.22 
 
 
521 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  55 
 
 
540 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  47.65 
 
 
509 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  49.2 
 
 
529 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  52.51 
 
 
509 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  52.1 
 
 
501 aa  420  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  53.08 
 
 
539 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  50.3 
 
 
584 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  49.5 
 
 
508 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  54.37 
 
 
502 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  46.12 
 
 
514 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  46.21 
 
 
528 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  51.65 
 
 
497 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  49.38 
 
 
514 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  54.23 
 
 
528 aa  392  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  48.38 
 
 
575 aa  389  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  46.41 
 
 
541 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  49.79 
 
 
516 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  43.94 
 
 
509 aa  372  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  49.36 
 
 
506 aa  371  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  47.28 
 
 
554 aa  368  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 
535 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  45.11 
 
 
601 aa  360  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  52.33 
 
 
477 aa  359  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  42.94 
 
 
516 aa  359  7e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  45.76 
 
 
563 aa  353  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  44.74 
 
 
525 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  44.74 
 
 
525 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  44.74 
 
 
525 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  41.57 
 
 
532 aa  349  6e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  47.2 
 
 
513 aa  347  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  43.53 
 
 
588 aa  343  5e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  46.09 
 
 
521 aa  342  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 
519 aa  339  8e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  44.62 
 
 
533 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 
513 aa  334  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.25 
 
 
537 aa  330  5.0000000000000004e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  44.21 
 
 
524 aa  315  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 
490 aa  311  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  45.05 
 
 
535 aa  311  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  42.35 
 
 
555 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  41.92 
 
 
503 aa  306  6e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  45.02 
 
 
536 aa  287  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  40.6 
 
 
508 aa  286  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  41.47 
 
 
505 aa  286  5e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  39.53 
 
 
516 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  40.85 
 
 
516 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  38.43 
 
 
503 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 
511 aa  267  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  37.86 
 
 
517 aa  264  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  37.47 
 
 
492 aa  260  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.42 
 
 
525 aa  258  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.68 
 
 
534 aa  247  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.94 
 
 
538 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 
500 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.23 
 
 
532 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 
500 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  36.1 
 
 
500 aa  237  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.08 
 
 
607 aa  232  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.32 
 
 
503 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  37.04 
 
 
517 aa  229  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  38.81 
 
 
528 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 
510 aa  227  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.94 
 
 
519 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 
516 aa  226  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  37.1 
 
 
514 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.98 
 
 
522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  34.19 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  38.51 
 
 
511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 
507 aa  220  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  38.23 
 
 
506 aa  219  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
520 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 
503 aa  219  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.02 
 
 
519 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 
501 aa  214  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  34.26 
 
 
501 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.54 
 
 
626 aa  213  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  33.69 
 
 
502 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  37.38 
 
 
594 aa  213  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  35.24 
 
 
501 aa  212  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  33.12 
 
 
513 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3332  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 
515 aa  209  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  32.3 
 
 
504 aa  209  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  34.47 
 
 
509 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.2 
 
 
520 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  34.75 
 
 
501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  32.13 
 
 
494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>