More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2993 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 607 aa  1190    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7431  major facilitator superfamily MFS_1  63.05 
 
 		 533 aa  579  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.65 
 
 		 522 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 		 520 aa  281  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.69 
 
 		 534 aa  277  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  37.85 
 
 		 503 aa  276  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 519 aa  274  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 		 507 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.97 
 
 		 534 aa  271  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.25 
 
 		 503 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.19 
 
 		 532 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 511 aa  266  8e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6678  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 		 523 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.78 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.6 
 
 		 522 aa  262  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  37.92 
 
 		 528 aa  259  8e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.1 
 
 		 525 aa  257  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  39.28 
 
 		 509 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 		 555 aa  254  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.61 
 
 		 532 aa  253  7e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 538 aa  252  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.62 
 
 		 531 aa  250  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.02 
 
 		 528 aa  249  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 		 509 aa  248  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 516 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 517 aa  245  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  38.75 
 
 		 502 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.03 
 
 		 519 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.05 
 
 		 626 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 525 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  35.56 
 
 		 525 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 525 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  36.14 
 
 		 554 aa  239  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1007  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 536 aa  236  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1024  major facilitator superfamily transporter  35.98 
 
 		 536 aa  236  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1034  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 536 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.83 
 
 		 502 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 526 aa  233  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 		 518 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  34.49 
 
 		 508 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.61 
 
 		 518 aa  231  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.3 
 
 		 478 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.67 
 
 		 520 aa  228  3e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.4 
 
 		 537 aa  227  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5055  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 524 aa  226  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 533 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.39 
 
 		 541 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.57 
 
 		 551 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 		 562 aa  220  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 516 aa  220  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.52 
 
 		 510 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.75 
 
 		 486 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.75 
 
 		 486 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.75 
 
 		 486 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.75 
 
 		 486 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.75 
 
 		 486 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.75 
 
 		 486 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.81 
 
 		 551 aa  219  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4140  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.9 
 
 		 505 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.67 
 
 		 488 aa  217  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2521  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 497 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.71 
 
 		 485 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  35.66 
 
 		 510 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.62 
 
 		 788 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 500 aa  213  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.07 
 
 		 532 aa  213  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 		 513 aa  213  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 509 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 524 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 524 aa  213  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8705  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.52 
 
 		 544 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.15 
 
 		 509 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 517 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.97 
 
 		 484 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.89 
 
 		 522 aa  210  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 536 aa  210  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 584 aa  209  9e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 		 478 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 503 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.04 
 
 		 488 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 521 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.16 
 
 		 478 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0890  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 565 aa  208  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 		 468 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 468 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 468 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 478 aa  206  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 514 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.82 
 
 		 489 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 588 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 		 521 aa  205  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.69 
 
 		 525 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.65 
 
 		 478 aa  205  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  34.25 
 
 		 467 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.16 
 
 		 486 aa  204  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3502  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 		 474 aa  203  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 528 aa  203  8e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.01 
 
 		 519 aa  203  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 540 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>