More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2639 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 529 aa  1018    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  56.55 
 
 		 517 aa  501  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  50.95 
 
 		 524 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  51 
 
 		 562 aa  462  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  55.74 
 
 		 521 aa  457  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  54.82 
 
 		 501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  50.97 
 
 		 526 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  49.71 
 
 		 518 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  49.24 
 
 		 528 aa  443  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  54.38 
 
 		 575 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  53.49 
 
 		 509 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  48.28 
 
 		 528 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  48.9 
 
 		 513 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  52.12 
 
 		 539 aa  411  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  50.11 
 
 		 588 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  47.91 
 
 		 514 aa  405  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  50.5 
 
 		 558 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  49.9 
 
 		 509 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 		 553 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  49.2 
 
 		 536 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  53.35 
 
 		 496 aa  401  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  45.03 
 
 		 509 aa  401  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  46.27 
 
 		 509 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  54.14 
 
 		 481 aa  395  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  49.41 
 
 		 540 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  44.53 
 
 		 516 aa  388  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  49.11 
 
 		 554 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  42.56 
 
 		 541 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  49.36 
 
 		 506 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  50.22 
 
 		 513 aa  371  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  44.6 
 
 		 508 aa  368  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  45.38 
 
 		 584 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  51.11 
 
 		 477 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 532 aa  360  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  46.64 
 
 		 524 aa  360  5e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  48.13 
 
 		 521 aa  358  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  50.21 
 
 		 502 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  47.88 
 
 		 528 aa  357  3.9999999999999996e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  42.8 
 
 		 519 aa  355  8.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  45.94 
 
 		 555 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  45.21 
 
 		 505 aa  354  2.9999999999999997e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  43.73 
 
 		 535 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.49 
 
 		 537 aa  351  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 		 601 aa  349  7e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  47.28 
 
 		 516 aa  347  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  43.5 
 
 		 525 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  43.5 
 
 		 525 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  43.5 
 
 		 525 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  48.78 
 
 		 563 aa  336  5e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 533 aa  329  6e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  45.51 
 
 		 508 aa  327  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  44.1 
 
 		 514 aa  326  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  46.79 
 
 		 536 aa  323  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 		 503 aa  317  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  41.52 
 
 		 513 aa  315  9e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 		 497 aa  313  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 		 517 aa  303  6.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  42.46 
 
 		 535 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 		 490 aa  303  7.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  39.23 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  39.5 
 
 		 516 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  43.25 
 
 		 517 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.39 
 
 		 525 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  35.31 
 
 		 492 aa  256  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  36.58 
 
 		 511 aa  256  9e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.06 
 
 		 538 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 503 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 500 aa  249  8e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 514 aa  249  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 520 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 500 aa  248  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  43.82 
 
 		 528 aa  247  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  37.11 
 
 		 500 aa  247  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  41.01 
 
 		 506 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  39.46 
 
 		 511 aa  243  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  36.38 
 
 		 516 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  36.85 
 
 		 513 aa  236  8e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 495 aa  234  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.68 
 
 		 503 aa  231  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.85 
 
 		 534 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3408  major facilitator superfamily MFS_1  41.77 
 
 		 524 aa  229  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.66 
 
 		 626 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 494 aa  226  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 		 510 aa  226  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  39.11 
 
 		 501 aa  226  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.5 
 
 		 522 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.96 
 
 		 532 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.33 
 
 		 519 aa  219  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  35.59 
 
 		 495 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  35.81 
 
 		 495 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  35.81 
 
 		 495 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  35.81 
 
 		 495 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3332  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 515 aa  218  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  35.81 
 
 		 495 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  36.38 
 
 		 594 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 504 aa  213  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.27 
 
 		 607 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 501 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  33.48 
 
 		 501 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 523 aa  210  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>