More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3332 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3332  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 515 aa  966    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  44.73 
 
 		 521 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  35.83 
 
 		 562 aa  277  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 		 517 aa  277  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  39.45 
 
 		 524 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  38.64 
 
 		 518 aa  267  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  39.96 
 
 		 513 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 509 aa  256  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  38 
 
 		 509 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  36.4 
 
 		 528 aa  252  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 526 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  45.38 
 
 		 506 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 		 528 aa  247  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  36.99 
 
 		 508 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 506 aa  243  7e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 541 aa  239  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  41.82 
 
 		 496 aa  237  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  36.53 
 
 		 553 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 		 516 aa  236  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 529 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 		 509 aa  233  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 		 535 aa  233  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  38.51 
 
 		 521 aa  233  8.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  39.87 
 
 		 501 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 555 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 477 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 532 aa  229  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  39.38 
 
 		 588 aa  229  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 519 aa  229  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 514 aa  229  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 536 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 481 aa  224  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  37.45 
 
 		 509 aa  223  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  38.7 
 
 		 524 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  41.48 
 
 		 513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  39.33 
 
 		 554 aa  219  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 575 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 540 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 490 aa  217  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 584 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  38 
 
 		 558 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 		 500 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 		 514 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  41.85 
 
 		 539 aa  210  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  40.33 
 
 		 528 aa  209  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.17 
 
 		 537 aa  209  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  34.84 
 
 		 500 aa  209  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 503 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 		 497 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  33.48 
 
 		 500 aa  207  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 508 aa  206  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  37.15 
 
 		 516 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 		 601 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  36.71 
 
 		 505 aa  201  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 533 aa  199  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  39.18 
 
 		 536 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  36.36 
 
 		 525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 514 aa  197  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  38.91 
 
 		 502 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  35.75 
 
 		 535 aa  196  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 563 aa  196  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 		 513 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  38.95 
 
 		 517 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 510 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 504 aa  186  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  33.88 
 
 		 516 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 503 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 517 aa  180  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  33.33 
 
 		 492 aa  180  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 495 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.79 
 
 		 538 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  36.71 
 
 		 528 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  34.06 
 
 		 501 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 523 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 501 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1066  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 		 496 aa  166  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  34.42 
 
 		 513 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.1 
 
 		 534 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 		 516 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.89 
 
 		 525 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 520 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 494 aa  157  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.92 
 
 		 503 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 		 511 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 594 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  31.98 
 
 		 495 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  31.98 
 
 		 495 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  32.4 
 
 		 495 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  31.98 
 
 		 495 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.39 
 
 		 626 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  31.98 
 
 		 495 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.93 
 
 		 607 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 		 516 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 519 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.59 
 
 		 531 aa  147  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.33 
 
 		 493 aa  139  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.45 
 
 		 478 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>