More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1066 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1066  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
496 aa  942    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  71.98 
 
 
594 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  67.14 
 
 
501 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  65.34 
 
 
501 aa  493  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2153  major facilitator superfamily MFS_1  62.55 
 
 
510 aa  466  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0717  major facilitator superfamily transporter  59.52 
 
 
510 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  47.22 
 
 
500 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  44.91 
 
 
500 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  45.51 
 
 
500 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  44.2 
 
 
495 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  45.11 
 
 
504 aa  361  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  48.56 
 
 
514 aa  358  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  45.36 
 
 
503 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  48.61 
 
 
501 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  48.16 
 
 
501 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  40.71 
 
 
533 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  40.79 
 
 
535 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 
528 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  40.13 
 
 
509 aa  270  5e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 
511 aa  270  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  39.96 
 
 
525 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  39.96 
 
 
525 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  39.96 
 
 
525 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  38.28 
 
 
513 aa  260  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 
516 aa  259  8e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  42.08 
 
 
513 aa  259  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  36.43 
 
 
526 aa  256  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  38.76 
 
 
528 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  39.7 
 
 
513 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  41.34 
 
 
517 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  38.65 
 
 
508 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 
524 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 
517 aa  249  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  38.94 
 
 
494 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 
517 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 
539 aa  247  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  39.14 
 
 
554 aa  246  8e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 
562 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  40.4 
 
 
505 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  41.69 
 
 
528 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 
555 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  38.25 
 
 
588 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 
521 aa  243  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.69 
 
 
537 aa  243  7e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 
521 aa  242  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 
523 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.9 
 
 
519 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  39.24 
 
 
558 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 
503 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  35.31 
 
 
514 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  39.96 
 
 
510 aa  236  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  37.1 
 
 
509 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 
518 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  34.12 
 
 
584 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 
519 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  36.66 
 
 
495 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  41.26 
 
 
481 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  37.09 
 
 
501 aa  230  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  36.65 
 
 
509 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  36.44 
 
 
495 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  36.44 
 
 
495 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  36.44 
 
 
495 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 
520 aa  229  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  42.62 
 
 
516 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  36.5 
 
 
495 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  36.53 
 
 
532 aa  227  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 
541 aa  227  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 
524 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 
490 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  36.13 
 
 
508 aa  223  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  36.73 
 
 
509 aa  220  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 
535 aa  219  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  40.6 
 
 
477 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  36.92 
 
 
536 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 
516 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  37.83 
 
 
553 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  36.18 
 
 
529 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 
536 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  36.38 
 
 
513 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  37.25 
 
 
540 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.69 
 
 
525 aa  213  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 
503 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  38.91 
 
 
506 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 
497 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  36.13 
 
 
575 aa  211  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  37.71 
 
 
507 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  38.39 
 
 
563 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.19 
 
 
503 aa  207  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.6 
 
 
534 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 
601 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  39.09 
 
 
496 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.48 
 
 
522 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 
514 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.94 
 
 
522 aa  197  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  36.25 
 
 
519 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  37.96 
 
 
502 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  33.84 
 
 
516 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 
502 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  36.66 
 
 
509 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  38.77 
 
 
528 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.130384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>