More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5220 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  100 
 
 		 558 aa  1048    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  52.97 
 
 		 524 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  54.71 
 
 		 526 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  56.88 
 
 		 521 aa  455  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  50.93 
 
 		 528 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  57.77 
 
 		 517 aa  452  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  57.38 
 
 		 513 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  56.5 
 
 		 496 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  52.18 
 
 		 509 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  50.1 
 
 		 562 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  60.42 
 
 		 481 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  54.67 
 
 		 536 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  54.41 
 
 		 539 aa  425  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  53.39 
 
 		 501 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  50.5 
 
 		 529 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  46.76 
 
 		 518 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  52.13 
 
 		 540 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  49.61 
 
 		 508 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  52.29 
 
 		 509 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  50.69 
 
 		 575 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  55.58 
 
 		 502 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  51.49 
 
 		 509 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  48.74 
 
 		 528 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  46.14 
 
 		 514 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  49.9 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  51.15 
 
 		 516 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  44.85 
 
 		 541 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  48.34 
 
 		 588 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 		 553 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 		 509 aa  364  2e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  46.54 
 
 		 584 aa  364  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 		 535 aa  353  5.9999999999999994e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  52.27 
 
 		 528 aa  352  8.999999999999999e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  52.04 
 
 		 477 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  46.47 
 
 		 563 aa  351  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  50.1 
 
 		 497 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  48.21 
 
 		 554 aa  346  5e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  48.39 
 
 		 514 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 533 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  45.66 
 
 		 521 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.64 
 
 		 537 aa  336  7e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  47.43 
 
 		 601 aa  333  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  45.53 
 
 		 508 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  48.35 
 
 		 513 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  48.33 
 
 		 513 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 		 519 aa  327  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 		 516 aa  327  4.0000000000000003e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 525 aa  326  7e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  44.71 
 
 		 525 aa  326  7e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 525 aa  326  7e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  42.08 
 
 		 532 aa  323  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  44.68 
 
 		 535 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  44.51 
 
 		 555 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  46.56 
 
 		 524 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  43.55 
 
 		 503 aa  311  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  42.38 
 
 		 505 aa  295  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  39.92 
 
 		 517 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  45.11 
 
 		 536 aa  282  9e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  41 
 
 		 516 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  45.74 
 
 		 506 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  42.02 
 
 		 528 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  42.18 
 
 		 517 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  39.71 
 
 		 511 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  41.76 
 
 		 510 aa  258  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  38.85 
 
 		 516 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 500 aa  253  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  38.1 
 
 		 492 aa  249  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  38.59 
 
 		 503 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  36.16 
 
 		 500 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 504 aa  247  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 501 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 495 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.97 
 
 		 538 aa  240  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.66 
 
 		 525 aa  241  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 514 aa  233  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  35.14 
 
 		 500 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  37.76 
 
 		 513 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.77 
 
 		 534 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  37.85 
 
 		 516 aa  231  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.74 
 
 		 519 aa  229  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.4 
 
 		 520 aa  227  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  39.36 
 
 		 511 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3408  major facilitator superfamily MFS_1  42.17 
 
 		 524 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 594 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  38.79 
 
 		 501 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36 
 
 		 522 aa  220  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.79 
 
 		 532 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 		 503 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 501 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  36.59 
 
 		 501 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 507 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1066  major facilitator superfamily MFS_1  45.08 
 
 		 496 aa  204  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.95 
 
 		 626 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 519 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  33.74 
 
 		 502 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2153  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 		 510 aa  200  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0717  major facilitator superfamily transporter  35.6 
 
 		 510 aa  198  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  33.47 
 
 		 494 aa  196  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3332  major facilitator superfamily MFS_1  38.43 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.25944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>