More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2114 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
501 aa  937    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  65.58 
 
 
501 aa  494  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2153  major facilitator superfamily MFS_1  64.54 
 
 
510 aa  477  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1066  major facilitator superfamily MFS_1  66.23 
 
 
496 aa  478  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  64.96 
 
 
594 aa  475  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0717  major facilitator superfamily transporter  58.69 
 
 
510 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  46.79 
 
 
500 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  49.16 
 
 
500 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  48.61 
 
 
500 aa  365  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  46.19 
 
 
504 aa  361  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  45.27 
 
 
495 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  50 
 
 
514 aa  355  8.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  45.94 
 
 
503 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  49.13 
 
 
501 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 
509 aa  324  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  49.03 
 
 
501 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  41.99 
 
 
528 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  41.4 
 
 
533 aa  296  6e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  41.72 
 
 
524 aa  286  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  44.13 
 
 
513 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  40.12 
 
 
517 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 
517 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  43.2 
 
 
558 aa  276  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  40.6 
 
 
535 aa  276  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  40.78 
 
 
525 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  40.56 
 
 
554 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  40.78 
 
 
525 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
555 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  40.78 
 
 
525 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  42.38 
 
 
513 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 
513 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  41.31 
 
 
508 aa  267  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 
588 aa  266  8.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 
511 aa  266  8.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  43.02 
 
 
517 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  41.63 
 
 
509 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  40.56 
 
 
521 aa  258  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  38.71 
 
 
518 aa  256  6e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  38.41 
 
 
562 aa  256  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 
510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  37.31 
 
 
495 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 
501 aa  253  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  37.09 
 
 
495 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  37.09 
 
 
495 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  37.09 
 
 
495 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  37.09 
 
 
495 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 
523 aa  250  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 
521 aa  249  8e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.45 
 
 
537 aa  249  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  38.01 
 
 
526 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  40.89 
 
 
516 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  39.7 
 
 
540 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 
490 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  37.56 
 
 
528 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  38.87 
 
 
529 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  40.81 
 
 
516 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 
516 aa  244  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 
539 aa  244  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.89 
 
 
519 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  42.67 
 
 
481 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  36.4 
 
 
520 aa  243  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  38.12 
 
 
536 aa  242  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 
541 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 
519 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  39.03 
 
 
505 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  40.47 
 
 
524 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  36.84 
 
 
509 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  38.86 
 
 
509 aa  239  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 
513 aa  239  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
503 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  37.24 
 
 
514 aa  239  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  38.88 
 
 
575 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  37.53 
 
 
494 aa  238  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  36.18 
 
 
532 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  41.46 
 
 
528 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 
535 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  40.42 
 
 
536 aa  233  8.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  38.1 
 
 
508 aa  229  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 
496 aa  227  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  38.39 
 
 
477 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 
553 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 
503 aa  227  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  41.36 
 
 
506 aa  227  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  37.35 
 
 
519 aa  226  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.12 
 
 
522 aa  226  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  36.36 
 
 
584 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  38.56 
 
 
507 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.5 
 
 
534 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.25 
 
 
525 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 
497 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.53 
 
 
503 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  41.23 
 
 
502 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  39.24 
 
 
563 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.66 
 
 
520 aa  210  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 
528 aa  209  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.06 
 
 
538 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  36.04 
 
 
502 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 
601 aa  206  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 
514 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.93 
 
 
532 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>