More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1113 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 588 aa  1110    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  54.71 
 
 		 509 aa  503  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  55.51 
 
 		 528 aa  491  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  55.38 
 
 		 554 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  52.86 
 
 		 516 aa  455  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  54.4 
 
 		 517 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  50.2 
 
 		 532 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  58.02 
 
 		 513 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  50.4 
 
 		 519 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  53.83 
 
 		 524 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 521 aa  415  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  54.07 
 
 		 505 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  48.11 
 
 		 562 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  47.49 
 
 		 518 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  49.32 
 
 		 541 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  48.4 
 
 		 501 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  49.79 
 
 		 529 aa  398  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  46.43 
 
 		 528 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  48.23 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  46.53 
 
 		 526 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 584 aa  391  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.14 
 
 		 537 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  49.5 
 
 		 575 aa  381  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  49.04 
 
 		 539 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  44.98 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  47.02 
 
 		 558 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  48.1 
 
 		 509 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  47.65 
 
 		 555 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  45.96 
 
 		 601 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  53.4 
 
 		 536 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  46.51 
 
 		 533 aa  363  4e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  48.25 
 
 		 535 aa  362  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  47.38 
 
 		 525 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  47.38 
 
 		 525 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  47.38 
 
 		 525 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  47.35 
 
 		 563 aa  359  9e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  47.85 
 
 		 508 aa  356  7.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  44.51 
 
 		 514 aa  353  5e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  50.21 
 
 		 521 aa  353  5.9999999999999994e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  45.59 
 
 		 509 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  45.78 
 
 		 509 aa  350  4e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  46.58 
 
 		 540 aa  350  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  49.11 
 
 		 496 aa  347  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  45.63 
 
 		 508 aa  347  5e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  49.47 
 
 		 481 aa  346  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  47.05 
 
 		 535 aa  341  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  47.81 
 
 		 506 aa  335  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  46.17 
 
 		 477 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  49.37 
 
 		 528 aa  332  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  48.72 
 
 		 502 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  43.53 
 
 		 536 aa  327  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  44.98 
 
 		 516 aa  320  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 553 aa  317  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  42.74 
 
 		 490 aa  315  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  45.05 
 
 		 513 aa  313  6.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  43.85 
 
 		 516 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  42.35 
 
 		 503 aa  306  5.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  40.31 
 
 		 517 aa  306  9.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  45.19 
 
 		 497 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  44.27 
 
 		 517 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  44.11 
 
 		 528 aa  295  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  42.92 
 
 		 514 aa  293  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3408  major facilitator superfamily MFS_1  45.4 
 
 		 524 aa  288  2.9999999999999996e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 		 511 aa  288  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 		 520 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  41.7 
 
 		 516 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.12 
 
 		 525 aa  277  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 		 500 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  38.23 
 
 		 500 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 503 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  38.1 
 
 		 492 aa  269  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  41.47 
 
 		 504 aa  267  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  42.5 
 
 		 511 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  40.12 
 
 		 510 aa  266  5.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.91 
 
 		 534 aa  260  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 514 aa  259  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.07 
 
 		 538 aa  250  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  39.7 
 
 		 495 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  39.49 
 
 		 495 aa  250  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  39.7 
 
 		 495 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.25 
 
 		 503 aa  249  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  39.7 
 
 		 495 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  37.52 
 
 		 516 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  39.7 
 
 		 495 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  36.74 
 
 		 500 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  38.49 
 
 		 495 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  40.38 
 
 		 507 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 494 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  39.41 
 
 		 502 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 519 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.33 
 
 		 626 aa  237  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  35.35 
 
 		 503 aa  236  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.84 
 
 		 519 aa  233  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.65 
 
 		 522 aa  230  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.87 
 
 		 520 aa  229  8e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  37.42 
 
 		 513 aa  229  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  40.85 
 
 		 501 aa  226  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 509 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 		 501 aa  220  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  39.01 
 
 		 501 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>