More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0141 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
511 aa  984    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  65.48 
 
 
510 aa  542  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  59.28 
 
 
516 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  48.91 
 
 
516 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  43.92 
 
 
517 aa  320  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 
516 aa  320  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  41.87 
 
 
525 aa  316  6e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  41.87 
 
 
525 aa  316  6e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  41.87 
 
 
525 aa  316  6e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 
528 aa  311  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 
555 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
509 aa  303  6.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  41.78 
 
 
533 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  42.69 
 
 
517 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  42.77 
 
 
508 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  40.94 
 
 
521 aa  296  8e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  43.56 
 
 
513 aa  292  9e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  39.33 
 
 
528 aa  292  9e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  39.38 
 
 
518 aa  289  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 
500 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  41.52 
 
 
535 aa  287  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 
517 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  41.27 
 
 
588 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  44.73 
 
 
524 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  45.33 
 
 
528 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  39.67 
 
 
532 aa  279  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 
511 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  38.79 
 
 
500 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  39.22 
 
 
524 aa  272  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  40.25 
 
 
521 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  38.56 
 
 
584 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  38.86 
 
 
495 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  38.49 
 
 
516 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  38.84 
 
 
519 aa  270  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.07 
 
 
607 aa  269  8.999999999999999e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 
562 aa  269  8.999999999999999e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  39.8 
 
 
554 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  37.53 
 
 
504 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  40.67 
 
 
481 aa  266  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  40.46 
 
 
505 aa  265  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.88 
 
 
525 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  36.33 
 
 
500 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  34.69 
 
 
514 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.89 
 
 
537 aa  264  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  38.16 
 
 
540 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  39.29 
 
 
503 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 
513 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  37.06 
 
 
509 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  36.78 
 
 
526 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  41.44 
 
 
513 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 
553 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 
520 aa  260  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  41.79 
 
 
514 aa  259  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  37.88 
 
 
575 aa  258  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  39.4 
 
 
503 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  38.06 
 
 
519 aa  254  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  37.68 
 
 
509 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  38.01 
 
 
558 aa  253  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.15 
 
 
519 aa  253  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 
501 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.77 
 
 
534 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  39.31 
 
 
513 aa  251  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  38.87 
 
 
507 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.07 
 
 
538 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  37.74 
 
 
508 aa  249  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  40.51 
 
 
502 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 
529 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  36 
 
 
536 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 
601 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 
541 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  38.39 
 
 
501 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 
539 aa  243  7.999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  35.76 
 
 
535 aa  242  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  40.72 
 
 
501 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 
490 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.55 
 
 
522 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.78 
 
 
520 aa  239  6.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.23 
 
 
626 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  40.51 
 
 
536 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
497 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.17 
 
 
503 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.48 
 
 
502 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  36.02 
 
 
509 aa  234  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  37.28 
 
 
563 aa  231  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 
496 aa  229  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 
503 aa  229  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  37.71 
 
 
509 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  33.33 
 
 
492 aa  228  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  36.77 
 
 
494 aa  226  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 
514 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1066  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 
496 aa  223  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.66 
 
 
531 aa  223  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  38.3 
 
 
502 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.48 
 
 
488 aa  221  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.34 
 
 
478 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 
528 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.09 
 
 
522 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.84 
 
 
486 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.84 
 
 
486 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.84 
 
 
486 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>