More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1370 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 506 aa  933    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  45.44 
 
 		 521 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  43.2 
 
 		 562 aa  322  9.000000000000001e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  46.94 
 
 		 558 aa  309  8e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  43.52 
 
 		 517 aa  306  7e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 		 513 aa  305  9.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  41.28 
 
 		 524 aa  300  6e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  41.14 
 
 		 529 aa  295  9e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 		 501 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  40.76 
 
 		 526 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  43.69 
 
 		 528 aa  287  2.9999999999999996e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 528 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  38.28 
 
 		 518 aa  286  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 509 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 481 aa  272  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 509 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  43.85 
 
 		 496 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  39.77 
 
 		 535 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 		 553 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3332  major facilitator superfamily MFS_1  45.58 
 
 		 515 aa  266  8.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  43.08 
 
 		 588 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 509 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 575 aa  263  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  44.29 
 
 		 539 aa  263  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  39.26 
 
 		 508 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 		 509 aa  261  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  40.08 
 
 		 516 aa  257  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.17 
 
 		 537 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  38.23 
 
 		 536 aa  254  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 		 516 aa  253  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  41.31 
 
 		 506 aa  249  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 584 aa  249  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  41.65 
 
 		 554 aa  249  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 		 502 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 514 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  42.19 
 
 		 513 aa  246  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 563 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 		 601 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 540 aa  239  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  42.28 
 
 		 514 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 541 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  40.67 
 
 		 477 aa  236  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 		 519 aa  234  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 533 aa  233  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 525 aa  233  9e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  39.24 
 
 		 525 aa  233  9e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 525 aa  233  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 		 521 aa  232  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  36.58 
 
 		 490 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 555 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  40.86 
 
 		 513 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 532 aa  221  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  39.79 
 
 		 497 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  42.75 
 
 		 528 aa  217  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  37.7 
 
 		 516 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  39.52 
 
 		 505 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 503 aa  210  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  39.33 
 
 		 524 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  37.75 
 
 		 535 aa  207  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 508 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  35.21 
 
 		 492 aa  200  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.63 
 
 		 538 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 504 aa  193  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.92 
 
 		 525 aa  193  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 		 511 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 		 517 aa  190  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 		 500 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.16 
 
 		 534 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  40.34 
 
 		 517 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 		 536 aa  186  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 		 510 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 503 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 514 aa  184  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 500 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 495 aa  182  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 		 516 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  39.72 
 
 		 528 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 511 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 520 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.04 
 
 		 503 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1066  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 496 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  31.89 
 
 		 500 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  36.67 
 
 		 501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  35.63 
 
 		 502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.35 
 
 		 532 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 519 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  35.8 
 
 		 501 aa  158  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 501 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 503 aa  156  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.7 
 
 		 478 aa  156  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  33.13 
 
 		 513 aa  156  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.19 
 
 		 519 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 594 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.21 
 
 		 522 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 		 507 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.99 
 
 		 626 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 		 501 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.63 
 
 		 607 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 509 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 494 aa  143  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>