More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0879 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
519 aa  1003    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  78.17 
 
 
532 aa  707    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  56.61 
 
 
516 aa  514  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  53.23 
 
 
509 aa  491  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  60.08 
 
 
524 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  49.42 
 
 
528 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  55.71 
 
 
505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  50.3 
 
 
554 aa  441  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  50.51 
 
 
588 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  46.72 
 
 
517 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  45.61 
 
 
528 aa  385  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  47 
 
 
525 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  47 
 
 
525 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  47 
 
 
525 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  49.26 
 
 
513 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  45.89 
 
 
521 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  43.2 
 
 
526 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  44.22 
 
 
541 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  42.8 
 
 
529 aa  363  5.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  42.94 
 
 
555 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  44.63 
 
 
509 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  41.05 
 
 
524 aa  360  4e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  45.31 
 
 
533 aa  359  5e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.9 
 
 
537 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  42.48 
 
 
518 aa  355  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  42.24 
 
 
562 aa  352  7e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  47.85 
 
 
536 aa  342  9e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 
501 aa  335  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 
513 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  43.06 
 
 
508 aa  330  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  42.45 
 
 
540 aa  329  7e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  41.49 
 
 
536 aa  329  8e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  41.3 
 
 
517 aa  329  9e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  42.47 
 
 
558 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  43.14 
 
 
539 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  45.26 
 
 
481 aa  323  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  43.03 
 
 
509 aa  322  7e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 
535 aa  318  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  42.66 
 
 
575 aa  317  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  44.64 
 
 
535 aa  317  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 
516 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  45.67 
 
 
563 aa  314  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
496 aa  312  7.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  40.76 
 
 
584 aa  312  9e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  42.18 
 
 
508 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
601 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 
506 aa  308  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  38.76 
 
 
509 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  38.97 
 
 
553 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 
521 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  44.55 
 
 
477 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  43.6 
 
 
513 aa  303  7.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  39.64 
 
 
490 aa  300  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  42.59 
 
 
517 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  45.24 
 
 
502 aa  293  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  38.16 
 
 
514 aa  288  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 
528 aa  281  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  43.03 
 
 
528 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 
514 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  38.81 
 
 
494 aa  269  8e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 
511 aa  269  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 
516 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 
503 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  37.68 
 
 
504 aa  262  8.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  39.64 
 
 
519 aa  256  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  39.58 
 
 
497 aa  256  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  38.57 
 
 
500 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  37.2 
 
 
495 aa  253  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 
500 aa  252  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3408  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 
524 aa  252  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  36.25 
 
 
495 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  36.25 
 
 
495 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  36.25 
 
 
495 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  37.76 
 
 
503 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  36.25 
 
 
495 aa  248  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  36.25 
 
 
495 aa  248  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.18 
 
 
520 aa  245  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.52 
 
 
534 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.35 
 
 
528 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 
520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.49 
 
 
525 aa  242  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  36.97 
 
 
500 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  39.48 
 
 
509 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  39.33 
 
 
514 aa  239  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.27 
 
 
522 aa  238  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  36.65 
 
 
516 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 
511 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.02 
 
 
538 aa  233  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  38 
 
 
501 aa  233  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  37.78 
 
 
513 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  34.47 
 
 
492 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.43 
 
 
532 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.87 
 
 
503 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 
516 aa  223  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 
507 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.54 
 
 
626 aa  220  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  35.97 
 
 
501 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 
523 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  37.87 
 
 
594 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>