More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3881 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
513 aa  945    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  49.03 
 
 
521 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 
517 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  48.41 
 
 
513 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  44.03 
 
 
562 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  46.2 
 
 
528 aa  364  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  44.59 
 
 
541 aa  361  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  45.8 
 
 
526 aa  361  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  45.68 
 
 
535 aa  360  5e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  48.99 
 
 
509 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  44.09 
 
 
553 aa  353  5e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  43.61 
 
 
509 aa  353  5.9999999999999994e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  43.98 
 
 
509 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  43.39 
 
 
518 aa  350  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  45.94 
 
 
536 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  44.87 
 
 
524 aa  345  8.999999999999999e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  45.42 
 
 
528 aa  345  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  46.95 
 
 
601 aa  336  5.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  43.86 
 
 
514 aa  336  5.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  46.56 
 
 
558 aa  336  7e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  44 
 
 
508 aa  335  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 
529 aa  334  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  44.07 
 
 
575 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  48.97 
 
 
496 aa  332  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  51.25 
 
 
521 aa  332  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  44.35 
 
 
584 aa  331  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  47.11 
 
 
563 aa  330  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  43.57 
 
 
509 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  44.56 
 
 
540 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  46.51 
 
 
516 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  46.54 
 
 
481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  46.12 
 
 
588 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  45.27 
 
 
501 aa  326  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  43.6 
 
 
519 aa  327  5e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  45.99 
 
 
539 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  43.52 
 
 
525 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  43.52 
 
 
525 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  43.52 
 
 
525 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  43.15 
 
 
503 aa  323  4e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  43.2 
 
 
532 aa  316  6e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  46.4 
 
 
490 aa  315  9e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  43.29 
 
 
516 aa  315  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  43.8 
 
 
554 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  42.88 
 
 
533 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  48.72 
 
 
513 aa  310  5e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  46.01 
 
 
506 aa  308  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 
555 aa  306  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.65 
 
 
537 aa  306  6e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  47.45 
 
 
477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  47.33 
 
 
502 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  45.05 
 
 
528 aa  300  5e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  43.37 
 
 
535 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  44.56 
 
 
524 aa  289  7e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  44.01 
 
 
516 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  42.91 
 
 
505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  43.86 
 
 
497 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  47.18 
 
 
536 aa  285  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 
511 aa  283  6.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  44.49 
 
 
514 aa  282  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  41.87 
 
 
508 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  38.54 
 
 
503 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  41.4 
 
 
517 aa  266  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
510 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 
517 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  39.27 
 
 
492 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  44.82 
 
 
528 aa  249  8e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  41.4 
 
 
516 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 
500 aa  242  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.31 
 
 
525 aa  239  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 
500 aa  239  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  35.77 
 
 
495 aa  239  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  37 
 
 
504 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.83 
 
 
538 aa  233  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 
520 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  38.75 
 
 
516 aa  231  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.8 
 
 
532 aa  229  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  36.06 
 
 
500 aa  229  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  41.1 
 
 
511 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  36.51 
 
 
513 aa  226  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  39.11 
 
 
514 aa  225  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.85 
 
 
534 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.42 
 
 
522 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.64 
 
 
503 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 
501 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.6 
 
 
519 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.9 
 
 
626 aa  208  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  38.3 
 
 
519 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  37.78 
 
 
501 aa  205  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  34.53 
 
 
494 aa  205  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  35.92 
 
 
502 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.9 
 
 
607 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 
507 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  38.29 
 
 
594 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 
506 aa  197  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  36.8 
 
 
501 aa  196  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  32.92 
 
 
495 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  37.23 
 
 
501 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  32.92 
 
 
495 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  32.92 
 
 
495 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  32.92 
 
 
495 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>