More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7102 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
517 aa  979    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  71.57 
 
 
528 aa  553  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  53.09 
 
 
517 aa  452  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  49.47 
 
 
513 aa  348  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  46.15 
 
 
525 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  46.15 
 
 
525 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  46.15 
 
 
525 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  42.83 
 
 
509 aa  342  1e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  45.27 
 
 
513 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  43.93 
 
 
533 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  43.3 
 
 
528 aa  326  6e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  45.27 
 
 
588 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  45.17 
 
 
516 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  45.76 
 
 
514 aa  320  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  43.74 
 
 
521 aa  317  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  42.6 
 
 
511 aa  317  4e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  42.57 
 
 
516 aa  317  5e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  41.19 
 
 
500 aa  316  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  45.28 
 
 
535 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  46.42 
 
 
503 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.51 
 
 
537 aa  315  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  46.76 
 
 
504 aa  314  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  44.09 
 
 
575 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  42.24 
 
 
500 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  41.12 
 
 
532 aa  307  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  48.45 
 
 
511 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  44.26 
 
 
519 aa  305  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  40.75 
 
 
500 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 
501 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  43.74 
 
 
517 aa  301  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  45.21 
 
 
510 aa  299  6e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  44.31 
 
 
554 aa  298  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  43.01 
 
 
495 aa  297  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 
555 aa  297  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 
503 aa  296  5e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  43.35 
 
 
495 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  42.8 
 
 
495 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  42.8 
 
 
495 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  42.8 
 
 
495 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  43.04 
 
 
494 aa  293  7e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  43.91 
 
 
508 aa  292  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  41.28 
 
 
562 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  39.18 
 
 
518 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  41.53 
 
 
521 aa  288  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  41.43 
 
 
523 aa  287  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  41.33 
 
 
495 aa  286  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  42.44 
 
 
524 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 
490 aa  283  8.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  41.56 
 
 
558 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  39.83 
 
 
509 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  38.85 
 
 
528 aa  280  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  40.5 
 
 
514 aa  280  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  43.29 
 
 
501 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 
524 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  37.58 
 
 
520 aa  276  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  41.21 
 
 
505 aa  274  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  40.49 
 
 
509 aa  272  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 
516 aa  270  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  43.72 
 
 
501 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 
513 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  39.23 
 
 
526 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  41.62 
 
 
584 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  39.61 
 
 
529 aa  266  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  41.89 
 
 
536 aa  260  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 
516 aa  258  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  40.61 
 
 
539 aa  257  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  41.48 
 
 
481 aa  257  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  37.55 
 
 
492 aa  256  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 
535 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  38.64 
 
 
508 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 
513 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2153  major facilitator superfamily MFS_1  39.8 
 
 
510 aa  253  6e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.82 
 
 
519 aa  253  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 
496 aa  253  8.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  40.98 
 
 
477 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.93 
 
 
532 aa  249  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.31 
 
 
538 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  39.4 
 
 
509 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  39.32 
 
 
507 aa  247  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.56 
 
 
525 aa  247  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  37.01 
 
 
540 aa  246  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 
502 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 
541 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.76 
 
 
534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1066  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 
496 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  42.01 
 
 
594 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  41.37 
 
 
501 aa  244  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  38.94 
 
 
519 aa  242  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  41.92 
 
 
501 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  38.51 
 
 
601 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.25 
 
 
522 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0717  major facilitator superfamily transporter  40.49 
 
 
510 aa  239  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  37.91 
 
 
536 aa  239  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.27 
 
 
503 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  41.68 
 
 
563 aa  237  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  38.97 
 
 
506 aa  238  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  35.76 
 
 
553 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  37.42 
 
 
497 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 
514 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  36.31 
 
 
516 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>