More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2592 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 520 aa  1019    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  64.09 
 
 		 503 aa  618  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  61.63 
 
 		 525 aa  588  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.77 
 
 		 532 aa  530  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.68 
 
 		 534 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.1 
 
 		 538 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.38 
 
 		 522 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.16 
 
 		 626 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.66 
 
 		 525 aa  320  5e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.92 
 
 		 520 aa  288  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.73 
 
 		 522 aa  286  8e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  40 
 
 		 519 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 533 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  39.2 
 
 		 507 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.97 
 
 		 519 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 		 516 aa  276  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.88 
 
 		 502 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  36.65 
 
 		 503 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.06 
 
 		 607 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 509 aa  270  4e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 509 aa  270  5e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  38.21 
 
 		 528 aa  267  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  40.77 
 
 		 502 aa  267  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 		 588 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 555 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 		 521 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  37.42 
 
 		 516 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.12 
 
 		 525 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  37.73 
 
 		 521 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 525 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  35.04 
 
 		 525 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 525 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.48 
 
 		 478 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.09 
 
 		 537 aa  255  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 		 513 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  37.55 
 
 		 513 aa  253  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.71 
 
 		 531 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.6 
 
 		 528 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  35.69 
 
 		 517 aa  249  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7124  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 517 aa  249  7e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  37.09 
 
 		 511 aa  249  8e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7431  major facilitator superfamily MFS_1  35.66 
 
 		 533 aa  249  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.05 
 
 		 485 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  35.11 
 
 		 535 aa  248  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.29 
 
 		 478 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 500 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 518 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  36.71 
 
 		 505 aa  244  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.05 
 
 		 484 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6678  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 		 523 aa  244  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 503 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.05 
 
 		 478 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 		 508 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 		 562 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 500 aa  240  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  37.58 
 
 		 517 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 		 486 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 		 486 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 		 486 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 		 486 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 		 486 aa  239  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 		 486 aa  239  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.62 
 
 		 478 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  35.89 
 
 		 554 aa  238  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 584 aa  233  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 526 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 503 aa  233  8.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 529 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 		 524 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 519 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.84 
 
 		 478 aa  229  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  35.95 
 
 		 539 aa  229  9e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 		 553 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 575 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 		 511 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.59 
 
 		 489 aa  227  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  37 
 
 		 514 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 504 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.74 
 
 		 532 aa  224  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 509 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  33.2 
 
 		 532 aa  223  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  33.89 
 
 		 508 aa  223  8e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 		 490 aa  223  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.2 
 
 		 522 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.53 
 
 		 512 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.95 
 
 		 518 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.14 
 
 		 458 aa  221  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1007  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 536 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1024  major facilitator superfamily transporter  33.6 
 
 		 536 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 		 517 aa  220  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 509 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 		 501 aa  219  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2521  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 497 aa  219  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 558 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.88 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  32.46 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1034  major facilitator transporter  33.4 
 
 		 536 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 528 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.53 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>