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for query gene Caci_0323 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
525 aa  1014    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 
520 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  41.43 
 
 
503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.04 
 
 
534 aa  318  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.86 
 
 
525 aa  307  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.74 
 
 
532 aa  302  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.87 
 
 
538 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.32 
 
 
522 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.99 
 
 
520 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.18 
 
 
626 aa  228  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.03 
 
 
525 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.97 
 
 
519 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 
503 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.17 
 
 
607 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.91 
 
 
534 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.58 
 
 
489 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.77 
 
 
509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  37.08 
 
 
533 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 
507 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 
478 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.31 
 
 
540 aa  196  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 
502 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.46 
 
 
512 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 
509 aa  194  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  33.49 
 
 
519 aa  193  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 
478 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 
478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 
518 aa  190  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
562 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 
484 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 
528 aa  188  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 
478 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.47 
 
 
511 aa  187  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7124  major facilitator transporter  32.41 
 
 
517 aa  186  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.44 
 
 
522 aa  186  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 
588 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  31.8 
 
 
517 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  34.89 
 
 
500 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.73 
 
 
531 aa  184  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.13 
 
 
505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 
500 aa  183  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 
500 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.29 
 
 
504 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 
517 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  35.92 
 
 
535 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 
486 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 
486 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 
486 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 
486 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 
486 aa  179  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 
486 aa  179  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7431  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 
533 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 
553 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 
478 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.24 
 
 
500 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
520 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.89 
 
 
609 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  34.69 
 
 
525 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  34.69 
 
 
525 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  34.69 
 
 
525 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  33.1 
 
 
469 aa  177  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  34.77 
 
 
526 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  30.65 
 
 
492 aa  176  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
485 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  33.97 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 
503 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.91 
 
 
518 aa  174  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0890  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 
565 aa  174  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  31.59 
 
 
467 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 
513 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.75 
 
 
500 aa  173  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 
537 aa  173  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  33.19 
 
 
502 aa  173  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.75 
 
 
510 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  34.62 
 
 
509 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.91 
 
 
502 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 
521 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  35.35 
 
 
555 aa  171  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.77 
 
 
534 aa  171  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.78 
 
 
493 aa  170  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  34.27 
 
 
513 aa  170  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.08 
 
 
458 aa  170  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  31.67 
 
 
503 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.25 
 
 
475 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 
489 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.7 
 
 
478 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.87 
 
 
504 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.28 
 
 
539 aa  168  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  33.04 
 
 
540 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  33.33 
 
 
481 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.05 
 
 
505 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
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NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.78 
 
 
532 aa  167  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.79 
 
 
524 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.31 
 
 
494 aa  166  9e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.48 
 
 
522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
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NC_009338  Mflv_5055  major facilitator transporter  33.26 
 
 
524 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.93416 
 
 
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NC_008705  Mkms_1024  major facilitator superfamily transporter  33.67 
 
 
536 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  0.65546 
 
 
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NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  33.03 
 
 
495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
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