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for query gene Franean1_1542 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 532 aa  1021    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.81 
 
 		 528 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.58 
 
 		 524 aa  482  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.31 
 
 		 520 aa  457  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  45.64 
 
 		 530 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  45.03 
 
 		 522 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.69 
 
 		 529 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.8 
 
 		 522 aa  344  2.9999999999999997e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.73 
 
 		 520 aa  276  7e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.1 
 
 		 488 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.08 
 
 		 534 aa  263  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.78 
 
 		 478 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  36.57 
 
 		 467 aa  256  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5607  drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  39.06 
 
 		 475 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864613  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.79 
 
 		 489 aa  250  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.09 
 
 		 489 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.13 
 
 		 502 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 		 763 aa  246  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.95 
 
 		 788 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.82 
 
 		 539 aa  245  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.44 
 
 		 502 aa  241  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.86 
 
 		 504 aa  240  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.59 
 
 		 478 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.87 
 
 		 522 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 528 aa  238  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.76 
 
 		 472 aa  237  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.2 
 
 		 510 aa  237  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0971  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.47 
 
 		 475 aa  236  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2778  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 547 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.581095  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.93 
 
 		 518 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.77 
 
 		 500 aa  234  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
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NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.22 
 
 		 514 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.2 
 
 		 478 aa  233  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 519 aa  233  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.27 
 
 		 500 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.96 
 
 		 525 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.42 
 
 		 527 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.86 
 
 		 540 aa  231  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.51 
 
 		 498 aa  230  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.53 
 
 		 525 aa  230  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.52 
 
 		 509 aa  230  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.12 
 
 		 487 aa  230  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.74 
 
 		 468 aa  229  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.14 
 
 		 498 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.21 
 
 		 516 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.87 
 
 		 646 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 		 517 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.87 
 
 		 646 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.87 
 
 		 646 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.21 
 
 		 532 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.43 
 
 		 486 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.43 
 
 		 486 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.43 
 
 		 486 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 520 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.43 
 
 		 486 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.43 
 
 		 486 aa  225  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.43 
 
 		 486 aa  225  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 		 528 aa  224  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.46 
 
 		 487 aa  224  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.78 
 
 		 529 aa  223  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0761  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.99 
 
 		 534 aa  223  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.698382  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.5 
 
 		 503 aa  223  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.61 
 
 		 520 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.83 
 
 		 607 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.17 
 
 		 478 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.25 
 
 		 469 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.01 
 
 		 478 aa  222  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.74 
 
 		 516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.18 
 
 		 492 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.13 
 
 		 522 aa  221  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.7 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 525 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.4 
 
 		 626 aa  220  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.52 
 
 		 482 aa  220  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  33.77 
 
 		 525 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 525 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 527 aa  220  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.21 
 
 		 478 aa  220  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.01 
 
 		 486 aa  220  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.21 
 
 		 484 aa  220  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.44 
 
 		 493 aa  219  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 509 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  36.02 
 
 		 509 aa  219  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  33.26 
 
 		 511 aa  219  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.87 
 
 		 542 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 		 516 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.95 
 
 		 489 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  36.71 
 
 		 519 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.53 
 
 		 538 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.91 
 
 		 531 aa  217  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.58 
 
 		 490 aa  217  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.57 
 
 		 521 aa  216  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
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NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.05 
 
 		 471 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.85 
 
 		 519 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
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NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.27 
 
 		 512 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 533 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  36.32 
 
 		 469 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_3502  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.97 
 
 		 474 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 		 509 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
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