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for query gene Cpin_4689 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 516 aa  1020    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.37 
 
 		 539 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.16 
 
 		 542 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.49 
 
 		 583 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.41 
 
 		 520 aa  313  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.27 
 
 		 500 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.61 
 
 		 471 aa  302  7.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.03 
 
 		 500 aa  301  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.78 
 
 		 492 aa  298  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.54 
 
 		 502 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.62 
 
 		 486 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4620  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.32 
 
 		 470 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.07 
 
 		 522 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1801  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.85 
 
 		 504 aa  286  8e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0797811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.47 
 
 		 489 aa  281  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.09 
 
 		 613 aa  278  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  39.86 
 
 		 457 aa  278  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.86 
 
 		 529 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40 
 
 		 498 aa  266  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0976  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.94 
 
 		 537 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 465 aa  263  6.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3231  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.76 
 
 		 479 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.75 
 
 		 510 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  34.38 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1524  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 546 aa  236  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.565851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.57 
 
 		 504 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.27 
 
 		 516 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2240  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 463 aa  230  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0215877  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.22 
 
 		 478 aa  230  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.94 
 
 		 522 aa  227  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  34.79 
 
 		 534 aa  226  7e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.11 
 
 		 488 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 		 532 aa  223  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.34 
 
 		 489 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.75 
 
 		 452 aa  221  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.42 
 
 		 483 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 469 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 		 483 aa  217  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.3 
 
 		 487 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.16 
 
 		 468 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.14 
 
 		 498 aa  213  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.63 
 
 		 489 aa  213  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.42 
 
 		 502 aa  213  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.89 
 
 		 487 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 476 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0982  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.61 
 
 		 497 aa  209  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 528 aa  209  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.17 
 
 		 458 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 476 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 476 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.66 
 
 		 469 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.64 
 
 		 472 aa  207  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.32 
 
 		 534 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 		 457 aa  205  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.73 
 
 		 519 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.1 
 
 		 524 aa  203  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 476 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.75 
 
 		 626 aa  200  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.47 
 
 		 527 aa  200  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.9 
 
 		 529 aa  200  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.64 
 
 		 469 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.25 
 
 		 485 aa  200  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  33.25 
 
 		 492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.52 
 
 		 763 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.94 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.12 
 
 		 490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.98 
 
 		 522 aa  198  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.68 
 
 		 528 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.2 
 
 		 478 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 		 505 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.2 
 
 		 478 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 		 788 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  32.45 
 
 		 478 aa  196  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 		 540 aa  196  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 463 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 510 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.44 
 
 		 520 aa  195  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.57 
 
 		 478 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.8 
 
 		 532 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  32.93 
 
 		 1065 aa  196  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.2 
 
 		 479 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.3 
 
 		 538 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  32.2 
 
 		 478 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.51 
 
 		 506 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.2 
 
 		 479 aa  195  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.41 
 
 		 480 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.89 
 
 		 607 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 507 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.2 
 
 		 480 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.34 
 
 		 493 aa  195  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.97 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.89 
 
 		 541 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.2 
 
 		 478 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.33 
 
 		 519 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.78 
 
 		 466 aa  194  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.26 
 
 		 487 aa  194  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
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NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 520 aa  193  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.38 
 
 		 506 aa  193  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
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NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 506 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 506 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
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