More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3303 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
498 aa  957    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.91 
 
 
487 aa  428  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.4 
 
 
527 aa  365  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.14 
 
 
534 aa  350  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.37 
 
 
496 aa  346  5e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.58 
 
 
490 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.97 
 
 
519 aa  344  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.38 
 
 
763 aa  343  5e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.24 
 
 
487 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.62 
 
 
507 aa  335  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.42 
 
 
500 aa  333  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.32 
 
 
487 aa  333  5e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.66 
 
 
508 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.98 
 
 
553 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.46 
 
 
788 aa  321  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.79 
 
 
489 aa  320  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.28 
 
 
479 aa  319  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.65 
 
 
519 aa  319  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.77 
 
 
514 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  41.86 
 
 
494 aa  317  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.15 
 
 
474 aa  317  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.71 
 
 
479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.71 
 
 
479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.94 
 
 
479 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.82 
 
 
497 aa  314  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  44.12 
 
 
492 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.23 
 
 
487 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.23 
 
 
482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.23 
 
 
482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.79 
 
 
493 aa  310  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.38 
 
 
478 aa  301  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.35 
 
 
487 aa  300  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.38 
 
 
504 aa  300  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.19 
 
 
479 aa  300  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 
513 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  42.99 
 
 
490 aa  298  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  41.51 
 
 
492 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1424  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.72 
 
 
548 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589759  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1483  drug resistance MFS transporter  45.63 
 
 
480 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.52 
 
 
522 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7158  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.47 
 
 
502 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.454502 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.41 
 
 
480 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1398  drug resistance MFS transporter  45.41 
 
 
480 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  41.9 
 
 
497 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  43.51 
 
 
491 aa  290  3e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.83 
 
 
509 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.24 
 
 
506 aa  289  8e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.24 
 
 
480 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.24 
 
 
480 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.24 
 
 
480 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.24 
 
 
480 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  47.24 
 
 
480 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.24 
 
 
480 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47 
 
 
480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  42.32 
 
 
454 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.98 
 
 
478 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.98 
 
 
478 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1200  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.98 
 
 
478 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.98 
 
 
478 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  40.61 
 
 
506 aa  282  9e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.11 
 
 
1112 aa  278  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0272  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  44.1 
 
 
494 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.89 
 
 
482 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  43.29 
 
 
487 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.31 
 
 
502 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  38.93 
 
 
481 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.51 
 
 
499 aa  271  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  38.83 
 
 
470 aa  270  5.9999999999999995e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.73 
 
 
505 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 
518 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  43.04 
 
 
505 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.33 
 
 
512 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  41.48 
 
 
485 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  40.62 
 
 
475 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  40.83 
 
 
483 aa  264  3e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.76 
 
 
481 aa  262  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.64 
 
 
522 aa  259  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5578  major facilitator superfamily MFS_1  42.6 
 
 
478 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5138  major facilitator superfamily MFS_1  42.98 
 
 
477 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.18 
 
 
501 aa  257  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  36.86 
 
 
498 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2510  major facilitator superfamily MFS_1  43.1 
 
 
480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  38.98 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0776  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.9 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000908237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4580  major facilitator superfamily MFS_1  39.31 
 
 
500 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  41.7 
 
 
499 aa  253  7e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  38.79 
 
 
530 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  42.11 
 
 
471 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3442  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.92 
 
 
530 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.477749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  39.64 
 
 
501 aa  250  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  41.71 
 
 
482 aa  249  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 
478 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.8 
 
 
502 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  37.89 
 
 
477 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  38.05 
 
 
472 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  39.15 
 
 
489 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  38.55 
 
 
481 aa  246  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.72 
 
 
478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0633  major facilitator superfamily MFS_1  41.05 
 
 
474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0766  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.79 
 
 
499 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.176707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>