More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0402 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
509 aa  997    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  68.2 
 
 
499 aa  608  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  57.87 
 
 
487 aa  519  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  59.44 
 
 
505 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.89 
 
 
498 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.02 
 
 
788 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.7 
 
 
514 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  56.4 
 
 
512 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  57.41 
 
 
519 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0766  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.1 
 
 
499 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.176707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  53.83 
 
 
499 aa  406  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.02 
 
 
519 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  54.19 
 
 
501 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.91 
 
 
500 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.2 
 
 
504 aa  355  7.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.69 
 
 
503 aa  351  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  44.77 
 
 
486 aa  326  5e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 
506 aa  317  5e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0776  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.95 
 
 
488 aa  313  4.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000908237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5131  major facilitator superfamily MFS_1  44.35 
 
 
487 aa  313  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22804  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.09 
 
 
487 aa  304  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.44 
 
 
508 aa  299  7e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.92 
 
 
763 aa  289  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.95 
 
 
498 aa  287  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8633  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.22 
 
 
488 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.75 
 
 
527 aa  284  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.95 
 
 
493 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3988  major facilitator transporter  45.55 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  38.44 
 
 
490 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 
491 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0447  major facilitator superfamily MFS_1  46.68 
 
 
470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00443315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  38.58 
 
 
487 aa  267  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5575  major facilitator superfamily MFS_1  43.9 
 
 
469 aa  262  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.28 
 
 
519 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  37.8 
 
 
492 aa  260  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00960  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.52 
 
 
475 aa  253  7e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.16 
 
 
534 aa  252  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.81 
 
 
489 aa  245  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.66 
 
 
553 aa  243  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  39.15 
 
 
483 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  41.22 
 
 
505 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  40.19 
 
 
492 aa  239  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  37.5 
 
 
470 aa  237  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.67 
 
 
501 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  37.47 
 
 
481 aa  232  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.66 
 
 
490 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 
528 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.58 
 
 
474 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  35.01 
 
 
497 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.97 
 
 
522 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  37.56 
 
 
475 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.78 
 
 
479 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 
494 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.79 
 
 
1112 aa  223  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.86 
 
 
506 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  37.41 
 
 
477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  38.41 
 
 
482 aa  219  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3442  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.12 
 
 
530 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.477749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.9 
 
 
607 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.52 
 
 
532 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.35 
 
 
507 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.74 
 
 
478 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.07 
 
 
543 aa  216  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2068  major facilitator transporter  40.27 
 
 
496 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 
518 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5578  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 
478 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.81 
 
 
487 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  33.33 
 
 
498 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35 
 
 
487 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.52 
 
 
534 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.77 
 
 
496 aa  210  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.09 
 
 
520 aa  209  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.93 
 
 
473 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.81 
 
 
516 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.14 
 
 
583 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.57 
 
 
479 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 
488 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.66 
 
 
482 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.66 
 
 
482 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.23 
 
 
478 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.04 
 
 
757 aa  205  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.44 
 
 
487 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.65 
 
 
489 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2306  major facilitator superfamily transporter  35.53 
 
 
543 aa  203  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864673  normal  0.0994822 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.53 
 
 
480 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  37.53 
 
 
471 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 
485 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2510  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 
480 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1398  drug resistance MFS transporter  37.53 
 
 
480 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.13 
 
 
502 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.15 
 
 
478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  36.66 
 
 
454 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.15 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.72 
 
 
522 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1483  drug resistance MFS transporter  37.53 
 
 
480 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2211  major facilitator transporter  40 
 
 
480 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214988  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.52 
 
 
480 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.52 
 
 
480 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.52 
 
 
480 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.37 
 
 
479 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>