More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0947 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  100 
 
 
483 aa  932    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  70.32 
 
 
470 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  60.83 
 
 
481 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  50.7 
 
 
490 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  46.75 
 
 
487 aa  343  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2069  major facilitator superfamily permease  43.9 
 
 
440 aa  332  6e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1077  major facilitator superfamily permease  40.09 
 
 
444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.42 
 
 
508 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 
491 aa  294  2e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.88 
 
 
763 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.95 
 
 
487 aa  287  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.86 
 
 
487 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.41 
 
 
498 aa  279  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.36 
 
 
519 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.24 
 
 
493 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.96 
 
 
527 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  42.27 
 
 
482 aa  266  5e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.88 
 
 
509 aa  263  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.93 
 
 
519 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.01 
 
 
490 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  41.45 
 
 
506 aa  257  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.07 
 
 
507 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.16 
 
 
487 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.38 
 
 
553 aa  253  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.32 
 
 
478 aa  250  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.28 
 
 
479 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.26 
 
 
501 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.14 
 
 
474 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.9 
 
 
522 aa  242  7.999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  40.9 
 
 
475 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.83 
 
 
534 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.66 
 
 
514 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.16 
 
 
489 aa  236  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.55 
 
 
757 aa  235  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.64 
 
 
543 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.94 
 
 
788 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  38.43 
 
 
492 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.88 
 
 
499 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  36.59 
 
 
497 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.37 
 
 
487 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.44 
 
 
500 aa  233  8.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  39.45 
 
 
485 aa  233  8.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.84 
 
 
479 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  42.76 
 
 
505 aa  230  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  35.12 
 
 
467 aa  229  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  41.72 
 
 
501 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.12 
 
 
479 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 
733 aa  228  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.12 
 
 
479 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.12 
 
 
479 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.24 
 
 
489 aa  226  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.83 
 
 
504 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2211  major facilitator transporter  39.22 
 
 
480 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214988  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.29 
 
 
488 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1835  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 
501 aa  224  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0636096  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2306  major facilitator superfamily transporter  39.7 
 
 
543 aa  223  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864673  normal  0.0994822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.08 
 
 
528 aa  223  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3442  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.68 
 
 
530 aa  222  9e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.477749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.84 
 
 
504 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2075  major facilitator transporter  39.9 
 
 
529 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0542399  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2121  major facilitator superfamily transporter  39.9 
 
 
529 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.360369  normal  0.0488476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2058  major facilitator transporter  39.9 
 
 
529 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283059  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.61 
 
 
502 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 
457 aa  221  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.56 
 
 
468 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2068  major facilitator transporter  38.81 
 
 
496 aa  220  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.69 
 
 
482 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.27 
 
 
496 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  40.53 
 
 
492 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.69 
 
 
482 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.99 
 
 
480 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.99 
 
 
480 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.99 
 
 
480 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.82 
 
 
478 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.99 
 
 
480 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4680  major facilitator superfamily MFS_1  39.14 
 
 
467 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  41.99 
 
 
480 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.99 
 
 
480 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.87 
 
 
510 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.75 
 
 
480 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.34 
 
 
522 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.87 
 
 
481 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.45 
 
 
520 aa  215  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.434739  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.99 
 
 
497 aa  216  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1424  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.99 
 
 
548 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589759  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2307  major facilitator superfamily transporter  40.36 
 
 
508 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.018174  normal  0.0567456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  39.08 
 
 
499 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 
494 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  35.95 
 
 
503 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 
511 aa  213  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.12 
 
 
505 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 
486 aa  213  7.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.82 
 
 
502 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  37.75 
 
 
489 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0776  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.14 
 
 
488 aa  211  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000908237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  39.07 
 
 
471 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
532 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12861  integral membrane efflux protein efpA  37.53 
 
 
530 aa  208  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0945731  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 
478 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.82 
 
 
512 aa  207  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.038471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>