More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7158 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0272  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  93.03 
 
 
494 aa  740    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7158  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
502 aa  974    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.454502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  76.15 
 
 
497 aa  629  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  78.44 
 
 
482 aa  611  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  78.44 
 
 
482 aa  611  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  78.33 
 
 
479 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  77.43 
 
 
479 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  77.43 
 
 
479 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  77.43 
 
 
479 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  78.1 
 
 
479 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  75.17 
 
 
480 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  75.17 
 
 
480 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  75.17 
 
 
480 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  75.17 
 
 
480 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  75.4 
 
 
480 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  75.4 
 
 
480 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  75.17 
 
 
480 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  71.04 
 
 
480 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1483  drug resistance MFS transporter  71.25 
 
 
480 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1398  drug resistance MFS transporter  71.04 
 
 
480 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1424  EmrB/QacA family drug resistance transporter  74.72 
 
 
548 aa  547  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589759  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1200  EmrB/QacA family drug resistance transporter  70.62 
 
 
478 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  70.62 
 
 
478 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  70.62 
 
 
478 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  70.62 
 
 
478 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4076  major facilitator transporter  80.61 
 
 
437 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  66.74 
 
 
481 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  62.73 
 
 
487 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.18 
 
 
490 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.74 
 
 
534 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.32 
 
 
553 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.12 
 
 
507 aa  360  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.57 
 
 
496 aa  360  4e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.47 
 
 
498 aa  358  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  48.31 
 
 
492 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.66 
 
 
487 aa  339  8e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.85 
 
 
1112 aa  336  5.999999999999999e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.19 
 
 
487 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.25 
 
 
506 aa  331  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  47.84 
 
 
513 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.6 
 
 
482 aa  319  7.999999999999999e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.74 
 
 
763 aa  318  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.68 
 
 
487 aa  309  5.9999999999999995e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.52 
 
 
493 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.92 
 
 
527 aa  295  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.56 
 
 
489 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.58 
 
 
522 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.24 
 
 
508 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  45.24 
 
 
477 aa  282  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.15 
 
 
788 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.33 
 
 
474 aa  277  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  42.06 
 
 
492 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 
514 aa  276  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.2 
 
 
519 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  39.18 
 
 
494 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  39.47 
 
 
497 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.55 
 
 
500 aa  268  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.18 
 
 
509 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.82 
 
 
519 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.24 
 
 
478 aa  263  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.36 
 
 
473 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5138  major facilitator superfamily MFS_1  43.88 
 
 
477 aa  263  8e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  41.57 
 
 
490 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  44.68 
 
 
505 aa  259  7e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  43.6 
 
 
454 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  38.06 
 
 
481 aa  256  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.67 
 
 
487 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.83 
 
 
499 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 
491 aa  246  8e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 
499 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.57 
 
 
522 aa  244  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  41.01 
 
 
471 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  39.82 
 
 
501 aa  240  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5578  major facilitator superfamily MFS_1  41.51 
 
 
478 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  39.2 
 
 
475 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.41 
 
 
469 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  41.58 
 
 
483 aa  236  9e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  38.61 
 
 
470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  38.89 
 
 
487 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  42.2 
 
 
489 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  39.82 
 
 
481 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 
532 aa  233  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 
506 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.86 
 
 
478 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  39.4 
 
 
485 aa  230  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  38.01 
 
 
470 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  40.48 
 
 
463 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.87 
 
 
502 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4680  major facilitator superfamily MFS_1  38.89 
 
 
467 aa  225  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 
733 aa  223  4.9999999999999996e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.38 
 
 
540 aa  223  6e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 
528 aa  223  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0548  major facilitator transporter  37.37 
 
 
500 aa  223  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4580  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 
500 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  35.36 
 
 
530 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  36.39 
 
 
489 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 
518 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.4 
 
 
505 aa  220  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  35.11 
 
 
498 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  37.29 
 
 
472 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.507711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>