More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1130 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 491 aa  943    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.56 
 
 		 487 aa  347  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  45.08 
 
 		 490 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  45.22 
 
 		 487 aa  319  5e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.19 
 
 		 487 aa  316  5e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.43 
 
 		 519 aa  312  9e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.77 
 
 		 508 aa  312  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.42 
 
 		 763 aa  309  6.999999999999999e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.88 
 
 		 514 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.79 
 
 		 498 aa  303  5.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.24 
 
 		 788 aa  300  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.46 
 
 		 527 aa  299  7e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.53 
 
 		 509 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  43.09 
 
 		 470 aa  294  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 483 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.92 
 
 		 487 aa  281  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.91 
 
 		 489 aa  280  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.17 
 
 		 500 aa  279  8e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  40 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.04 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.9 
 
 		 512 aa  266  5.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40 
 
 		 474 aa  266  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.88 
 
 		 499 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  40.88 
 
 		 506 aa  263  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.76 
 
 		 757 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.67 
 
 		 490 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 		 733 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.46 
 
 		 534 aa  261  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.88 
 
 		 522 aa  260  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.87 
 
 		 505 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.05 
 
 		 507 aa  256  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  37.47 
 
 		 497 aa  254  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  38.62 
 
 		 492 aa  253  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.57 
 
 		 501 aa  251  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0766  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.14 
 
 		 499 aa  249  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.08 
 
 		 478 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  41.65 
 
 		 489 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  45.23 
 
 		 505 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.75 
 
 		 504 aa  246  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.4 
 
 		 503 aa  246  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.13 
 
 		 479 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  37.56 
 
 		 475 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  39.18 
 
 		 498 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  39.82 
 
 		 482 aa  240  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 		 501 aa  240  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.35 
 
 		 519 aa  240  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 499 aa  239  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.67 
 
 		 498 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3442  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.97 
 
 		 530 aa  236  7e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.477749  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.15 
 
 		 479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.41 
 
 		 479 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  40.81 
 
 		 471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.41 
 
 		 479 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2075  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 529 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0542399  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2121  major facilitator superfamily transporter  40.2 
 
 		 529 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.360369  normal  0.0488476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2058  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 529 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.37 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 486 aa  230  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 485 aa  230  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5131  major facilitator superfamily MFS_1  39.56 
 
 		 487 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.86 
 
 		 543 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3988  major facilitator transporter  39.28 
 
 		 482 aa  227  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 494 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.44 
 
 		 520 aa  226  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.434739  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.59 
 
 		 482 aa  226  9e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.59 
 
 		 482 aa  226  9e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 478 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.08 
 
 		 553 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  39.66 
 
 		 463 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0776  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.79 
 
 		 488 aa  223  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000908237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2306  major facilitator superfamily transporter  38.12 
 
 		 543 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864673  normal  0.0994822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.5 
 
 		 1112 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.04 
 
 		 496 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.24 
 
 		 487 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.67 
 
 		 506 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  37.61 
 
 		 481 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  38.94 
 
 		 492 aa  217  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0447  major facilitator superfamily MFS_1  41.52 
 
 		 470 aa  216  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00443315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 		 513 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.05 
 
 		 521 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5575  major facilitator superfamily MFS_1  40.18 
 
 		 469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.57 
 
 		 502 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.68 
 
 		 476 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.18 
 
 		 487 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12861  integral membrane efflux protein efpA  37.41 
 
 		 530 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0945731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.35 
 
 		 480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.85 
 
 		 522 aa  213  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0337  major facilitator superfamily MFS_1  39.13 
 
 		 494 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498428  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 		 503 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  38.24 
 
 		 477 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  42.12 
 
 		 480 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.12 
 
 		 480 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  38.19 
 
 		 454 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.88 
 
 		 480 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.88 
 
 		 480 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.88 
 
 		 480 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.88 
 
 		 480 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1149  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 460 aa  210  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8633  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.05 
 
 		 488 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.43 
 
 		 502 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>