More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4898 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  100 
 
 		 489 aa  924    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0337  major facilitator superfamily MFS_1  64.98 
 
 		 494 aa  478  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498428  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  60.13 
 
 		 481 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  59.86 
 
 		 485 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  49.53 
 
 		 471 aa  332  8e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0548  major facilitator transporter  47.11 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4316  major facilitator transporter  45.63 
 
 		 486 aa  323  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  51.82 
 
 		 463 aa  320  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1431  major facilitator superfamily MFS_1  53.15 
 
 		 733 aa  301  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.634406  normal  0.254269 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0693  major facilitator superfamily MFS_1  47.53 
 
 		 472 aa  300  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.72 
 
 		 487 aa  296  6e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2293  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 		 513 aa  284  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.98 
 
 		 763 aa  264  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.7 
 
 		 490 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 		 491 aa  258  2e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.29 
 
 		 527 aa  256  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.95 
 
 		 508 aa  253  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.63 
 
 		 487 aa  253  8.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.3 
 
 		 498 aa  249  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.85 
 
 		 507 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.39 
 
 		 487 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  38.46 
 
 		 498 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.74 
 
 		 519 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.33 
 
 		 474 aa  237  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.12 
 
 		 482 aa  237  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.12 
 
 		 482 aa  237  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.92 
 
 		 489 aa  236  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.97 
 
 		 493 aa  232  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  38.37 
 
 		 497 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.69 
 
 		 522 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  37.34 
 
 		 494 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.22 
 
 		 479 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  40.45 
 
 		 475 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  39.09 
 
 		 492 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.95 
 
 		 534 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.84 
 
 		 519 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 481 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.62 
 
 		 478 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.15 
 
 		 487 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 		 487 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  35.68 
 
 		 489 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 490 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.62 
 
 		 514 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 503 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.52 
 
 		 509 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  35.43 
 
 		 470 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.75 
 
 		 479 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  35.95 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 482 aa  212  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.48 
 
 		 757 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  34.79 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  38.81 
 
 		 492 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.47 
 
 		 479 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.47 
 
 		 479 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.47 
 
 		 479 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.74 
 
 		 788 aa  210  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  38.06 
 
 		 470 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 470 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.63 
 
 		 553 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  40.38 
 
 		 501 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.59 
 
 		 469 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.5 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.5 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.5 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.5 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.5 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.5 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.15 
 
 		 512 aa  207  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  39.66 
 
 		 505 aa  206  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 506 aa  207  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 		 457 aa  206  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 519 aa  206  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.94 
 
 		 496 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.46 
 
 		 480 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  41.46 
 
 		 480 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.46 
 
 		 480 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.47 
 
 		 1112 aa  204  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7158  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.71 
 
 		 502 aa  203  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.454502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  36.48 
 
 		 454 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.34 
 
 		 505 aa  203  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.7 
 
 		 524 aa  203  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.22 
 
 		 480 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.22 
 
 		 480 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.22 
 
 		 480 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.22 
 
 		 480 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.9 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1483  drug resistance MFS transporter  40.21 
 
 		 480 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  40.99 
 
 		 513 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.09 
 
 		 481 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0272  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  41.21 
 
 		 494 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.2 
 
 		 532 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 		 480 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1398  drug resistance MFS transporter  40 
 
 		 480 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.6 
 
 		 482 aa  199  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5578  major facilitator superfamily MFS_1  40.94 
 
 		 478 aa  199  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.52 
 
 		 497 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.3 
 
 		 478 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 478 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5131  major facilitator superfamily MFS_1  38.62 
 
 		 487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22804  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>