More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4046 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 543 aa  1057    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2075  major facilitator transporter  79.6 
 
 		 529 aa  788    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0542399  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2121  major facilitator superfamily transporter  79.6 
 
 		 529 aa  788    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.360369  normal  0.0488476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2306  major facilitator superfamily transporter  93.74 
 
 		 543 aa  926    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864673  normal  0.0994822 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12861  integral membrane efflux protein efpA  75.92 
 
 		 530 aa  759    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0945731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2058  major facilitator transporter  79.6 
 
 		 529 aa  788    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2307  major facilitator superfamily transporter  62.18 
 
 		 508 aa  551  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.018174  normal  0.0567456 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.19 
 
 		 520 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.434739  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.17 
 
 		 757 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  44.93 
 
 		 733 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.84 
 
 		 508 aa  287  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.73 
 
 		 519 aa  253  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.13 
 
 		 487 aa  245  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.2 
 
 		 763 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 483 aa  236  7e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 		 487 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 490 aa  233  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 491 aa  231  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.62 
 
 		 509 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  38.44 
 
 		 470 aa  225  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.29 
 
 		 527 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.39 
 
 		 501 aa  223  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 481 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3442  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.81 
 
 		 530 aa  219  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.477749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.98 
 
 		 788 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.76 
 
 		 487 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 486 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.19 
 
 		 498 aa  211  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.4 
 
 		 487 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  36.94 
 
 		 506 aa  207  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  33.66 
 
 		 497 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.52 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.58 
 
 		 507 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.84 
 
 		 500 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.88 
 
 		 519 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.65 
 
 		 482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.69 
 
 		 490 aa  202  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0776  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.13 
 
 		 488 aa  199  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000908237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.61 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.55 
 
 		 504 aa  197  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.05 
 
 		 534 aa  196  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  35.67 
 
 		 492 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 		 522 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.6 
 
 		 474 aa  194  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.31 
 
 		 512 aa  193  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.58 
 
 		 505 aa  193  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 482 aa  193  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  38.71 
 
 		 505 aa  192  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2069  major facilitator superfamily permease  32.2 
 
 		 440 aa  190  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.52 
 
 		 478 aa  189  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.89 
 
 		 553 aa  186  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 485 aa  184  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  38.28 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  34.45 
 
 		 492 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 470 aa  182  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0766  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.39 
 
 		 499 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176707 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.31 
 
 		 526 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  35.12 
 
 		 501 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  32.22 
 
 		 498 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 		 489 aa  180  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  33.78 
 
 		 475 aa  180  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  34.32 
 
 		 458 aa  177  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.6 
 
 		 478 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 		 463 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 478 aa  176  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5131  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 487 aa  176  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 494 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.33 
 
 		 515 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00960  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.64 
 
 		 475 aa  176  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.3 
 
 		 504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.47 
 
 		 521 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.36 
 
 		 502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.96 
 
 		 489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.8 
 
 		 514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.67 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2068  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 496 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.48 
 
 		 482 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.48 
 
 		 482 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.48 
 
 		 564 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.6 
 
 		 514 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 518 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  30.28 
 
 		 467 aa  171  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 513 aa  170  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2211  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 480 aa  169  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214988  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.87 
 
 		 579 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1524  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 		 546 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.565851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.41 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.26 
 
 		 503 aa  168  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.71 
 
 		 1112 aa  167  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.05 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.41 
 
 		 502 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.37 
 
 		 522 aa  167  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.71 
 
 		 480 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1077  major facilitator superfamily permease  32.15 
 
 		 444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.05 
 
 		 478 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.05 
 
 		 484 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 482 aa  166  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.37 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>