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for query gene Tbis_1255 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 
476 aa  886    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  65.19 
 
 
478 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.42 
 
 
478 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.25 
 
 
458 aa  354  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4757  major facilitator superfamily MFS_1  41 
 
 
633 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.67 
 
 
522 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.3 
 
 
763 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.36 
 
 
490 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.73 
 
 
507 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.02 
 
 
510 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.2 
 
 
527 aa  242  7.999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.24 
 
 
488 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.9 
 
 
498 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.9 
 
 
502 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.17 
 
 
522 aa  240  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.96 
 
 
522 aa  236  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 
534 aa  236  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  36.72 
 
 
492 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  37.47 
 
 
463 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.45 
 
 
487 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.12 
 
 
489 aa  230  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.59 
 
 
469 aa  230  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 
457 aa  230  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.76 
 
 
458 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.44 
 
 
521 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.92 
 
 
520 aa  227  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.32 
 
 
489 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.79 
 
 
528 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.08 
 
 
505 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.13 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.53 
 
 
540 aa  221  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.47 
 
 
482 aa  219  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 
478 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 
484 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.16 
 
 
506 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.91 
 
 
478 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.14 
 
 
490 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  38.41 
 
 
519 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.9 
 
 
489 aa  216  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.19 
 
 
525 aa  216  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.7 
 
 
486 aa  216  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.7 
 
 
486 aa  216  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.7 
 
 
486 aa  216  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 
646 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.27 
 
 
512 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.72 
 
 
469 aa  216  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.7 
 
 
486 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 
646 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.7 
 
 
486 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.7 
 
 
486 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.27 
 
 
646 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.61 
 
 
553 aa  214  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  38.74 
 
 
490 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 
463 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.95 
 
 
519 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.52 
 
 
534 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 
474 aa  213  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.87 
 
 
487 aa  213  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  36.67 
 
 
468 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  36.67 
 
 
468 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  38.25 
 
 
509 aa  212  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.93 
 
 
519 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 
520 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.76 
 
 
508 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 
478 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.53 
 
 
502 aa  210  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.2 
 
 
539 aa  210  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.9 
 
 
508 aa  210  5e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.08 
 
 
504 aa  209  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.8 
 
 
493 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.16 
 
 
627 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 
503 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  40.15 
 
 
474 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.08 
 
 
524 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.83 
 
 
488 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.68 
 
 
524 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  37.87 
 
 
475 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.28 
 
 
509 aa  206  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.93 
 
 
485 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.21 
 
 
480 aa  207  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.12 
 
 
583 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 
507 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.99 
 
 
479 aa  206  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  37.5 
 
 
483 aa  205  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  36.64 
 
 
502 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34 
 
 
534 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.15 
 
 
519 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.43 
 
 
505 aa  206  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  34.66 
 
 
528 aa  205  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0761  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.34 
 
 
534 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.698382  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
494 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.33 
 
 
478 aa  205  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  31.97 
 
 
534 aa  204  3e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.03 
 
 
525 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 
491 aa  203  4e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.07 
 
 
498 aa  203  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.41 
 
 
522 aa  203  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.22 
 
 
487 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.44 
 
 
479 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
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NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.12 
 
 
531 aa  202  9e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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