More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4580 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4580  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
500 aa  963    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1276  major facilitator superfamily MFS_1  59.2 
 
 
483 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8690  major facilitator superfamily MFS_1  57.68 
 
 
507 aa  465  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1718  major facilitator superfamily MFS_1  57.73 
 
 
500 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0892  major facilitator superfamily MFS_1  53.73 
 
 
508 aa  431  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  51.98 
 
 
472 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  48.58 
 
 
478 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  48.26 
 
 
489 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5620  major facilitator superfamily MFS_1  51.69 
 
 
488 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000613899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3744  major facilitator superfamily MFS_1  47.1 
 
 
484 aa  300  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.31 
 
 
498 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.74 
 
 
487 aa  276  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.46 
 
 
487 aa  276  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0772  major facilitator superfamily transporter  38.16 
 
 
464 aa  274  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.91 
 
 
490 aa  261  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  40.1 
 
 
497 aa  247  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1035  major facilitator superfamily MFS_1  42.46 
 
 
466 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 
494 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  36.23 
 
 
498 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0901  major facilitator superfamily MFS_1  42.4 
 
 
466 aa  238  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.52 
 
 
553 aa  237  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  38.06 
 
 
492 aa  236  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 
485 aa  236  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.9 
 
 
493 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.35 
 
 
534 aa  232  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.01 
 
 
519 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.07 
 
 
508 aa  229  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.56 
 
 
507 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.91 
 
 
489 aa  227  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.56 
 
 
496 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.63 
 
 
482 aa  223  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.63 
 
 
482 aa  223  9e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.05 
 
 
527 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.85 
 
 
482 aa  220  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4526  efflux transporter  50.38 
 
 
303 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344651  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.52 
 
 
478 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  40 
 
 
481 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  37.62 
 
 
492 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.59 
 
 
474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.08 
 
 
763 aa  213  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.32 
 
 
487 aa  213  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 
513 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.33 
 
 
506 aa  212  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.19 
 
 
519 aa  210  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.05 
 
 
522 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.55 
 
 
1112 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  38.01 
 
 
470 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7158  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.56 
 
 
502 aa  206  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.454502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  36.72 
 
 
503 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.62 
 
 
479 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  38.89 
 
 
471 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.66 
 
 
487 aa  202  9e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0272  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.32 
 
 
494 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.42 
 
 
485 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.17 
 
 
509 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  35.37 
 
 
470 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4316  major facilitator transporter  37.8 
 
 
486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444019  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.7 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  36.18 
 
 
477 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.26 
 
 
500 aa  196  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  32.28 
 
 
475 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.7 
 
 
788 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 
487 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.41 
 
 
500 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  32.38 
 
 
481 aa  194  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.68 
 
 
514 aa  193  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  37.24 
 
 
489 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  34.03 
 
 
470 aa  192  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 
482 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.15 
 
 
481 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  35.7 
 
 
482 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.92 
 
 
505 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.2 
 
 
502 aa  190  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1424  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.28 
 
 
548 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  39 
 
 
463 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.04 
 
 
476 aa  189  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.07 
 
 
479 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1483  drug resistance MFS transporter  39.9 
 
 
480 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.3 
 
 
480 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 
518 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.3 
 
 
480 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.3 
 
 
480 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.3 
 
 
480 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0337  major facilitator superfamily MFS_1  40.17 
 
 
494 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498428  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.06 
 
 
480 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.87 
 
 
487 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  33.41 
 
 
458 aa  187  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.66 
 
 
480 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  36.06 
 
 
480 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.06 
 
 
480 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1398  drug resistance MFS transporter  39.66 
 
 
480 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.67 
 
 
479 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.67 
 
 
479 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  34.49 
 
 
463 aa  186  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.67 
 
 
479 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  31.97 
 
 
490 aa  186  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3892  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 
511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.741716  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 
486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2293  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 
513 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 
500 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>