More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1424 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  95.62 
 
 		 480 aa  701    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  95.21 
 
 		 480 aa  698    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1424  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 548 aa  1062    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589759  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.15 
 
 		 479 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.15 
 
 		 479 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  81.63 
 
 		 479 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  95.62 
 
 		 480 aa  701    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  95.62 
 
 		 480 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  95.42 
 
 		 480 aa  699    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  95.42 
 
 		 480 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  95.62 
 
 		 480 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.12 
 
 		 479 aa  645    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.12 
 
 		 479 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1483  drug resistance MFS transporter  74.38 
 
 		 480 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  74.17 
 
 		 480 aa  571  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  75.78 
 
 		 482 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  75.78 
 
 		 482 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1398  drug resistance MFS transporter  74.17 
 
 		 480 aa  571  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1200  EmrB/QacA family drug resistance transporter  73.54 
 
 		 478 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  73.54 
 
 		 478 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  73.75 
 
 		 478 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  73.75 
 
 		 478 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7158  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  71.88 
 
 		 502 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.454502 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0272  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  74.49 
 
 		 494 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  73.74 
 
 		 497 aa  527  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  67.18 
 
 		 481 aa  479  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  64.37 
 
 		 487 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4076  major facilitator transporter  72.89 
 
 		 437 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.48 
 
 		 490 aa  401  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.13 
 
 		 498 aa  365  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.76 
 
 		 534 aa  362  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.77 
 
 		 507 aa  356  5.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.6 
 
 		 496 aa  352  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.73 
 
 		 553 aa  350  3e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.83 
 
 		 1112 aa  341  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.01 
 
 		 487 aa  341  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  47.14 
 
 		 492 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.23 
 
 		 482 aa  331  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.65 
 
 		 487 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.07 
 
 		 763 aa  319  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.39 
 
 		 506 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.49 
 
 		 508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  45.87 
 
 		 513 aa  306  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.01 
 
 		 527 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 		 494 aa  299  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.21 
 
 		 487 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  41.91 
 
 		 497 aa  284  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.28 
 
 		 519 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.17 
 
 		 489 aa  283  5.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.85 
 
 		 474 aa  283  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.01 
 
 		 493 aa  277  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  41.63 
 
 		 492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  44.5 
 
 		 477 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.21 
 
 		 478 aa  273  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.05 
 
 		 500 aa  270  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.51 
 
 		 473 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38 
 
 		 788 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.82 
 
 		 522 aa  264  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5138  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 		 477 aa  260  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 490 aa  259  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  44.31 
 
 		 454 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 		 491 aa  257  3e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 481 aa  257  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 		 499 aa  255  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.11 
 
 		 519 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 		 487 aa  253  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.26 
 
 		 487 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  41.72 
 
 		 505 aa  251  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.82 
 
 		 514 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.18 
 
 		 509 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 		 499 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  40.05 
 
 		 475 aa  247  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 483 aa  247  4e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  41.87 
 
 		 485 aa  245  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 		 506 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  41.56 
 
 		 518 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  40.13 
 
 		 481 aa  239  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 471 aa  236  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.7 
 
 		 522 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  37.26 
 
 		 470 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.78 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  39.22 
 
 		 501 aa  230  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.52 
 
 		 502 aa  229  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  41.11 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.86 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.14 
 
 		 504 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.2 
 
 		 502 aa  227  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  37.29 
 
 		 470 aa  226  7e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4680  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 467 aa  225  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  34.7 
 
 		 519 aa  226  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.7 
 
 		 540 aa  225  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23710  arabinose efflux permease family protein  41.09 
 
 		 469 aa  224  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.277036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5374  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 481 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.558764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  40.49 
 
 		 463 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  36.08 
 
 		 489 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.44 
 
 		 480 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.38 
 
 		 489 aa  219  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.42 
 
 		 488 aa  220  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2475  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 468 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1149  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>