More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0603 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 498 aa  942    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3231  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.62 
 
 		 479 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.24 
 
 		 529 aa  415  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.24 
 
 		 489 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47 
 
 		 502 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1801  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.11 
 
 		 504 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0797811  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.65 
 
 		 471 aa  375  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.52 
 
 		 486 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.74 
 
 		 613 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.17 
 
 		 492 aa  363  5.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.06 
 
 		 500 aa  352  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.22 
 
 		 500 aa  348  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.64 
 
 		 483 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  44.13 
 
 		 457 aa  302  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.89 
 
 		 542 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.73 
 
 		 583 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.17 
 
 		 520 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.85 
 
 		 539 aa  286  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.91 
 
 		 516 aa  282  9e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  44.08 
 
 		 465 aa  279  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0976  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.75 
 
 		 537 aa  276  9e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4620  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.06 
 
 		 470 aa  269  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.46 
 
 		 522 aa  266  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2240  major facilitator superfamily MFS_1  43.51 
 
 		 463 aa  260  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0215877  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.19 
 
 		 488 aa  259  7e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.2 
 
 		 489 aa  258  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  39.26 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.51 
 
 		 532 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
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NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.51 
 
 		 528 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.35 
 
 		 510 aa  249  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.48 
 
 		 478 aa  246  8e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.22 
 
 		 489 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.61 
 
 		 502 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.45 
 
 		 524 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.13 
 
 		 478 aa  240  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1524  major facilitator superfamily MFS_1  39.17 
 
 		 546 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.565851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.23 
 
 		 529 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.17 
 
 		 478 aa  236  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 488 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 488 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 479 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 		 494 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 482 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
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NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.71 
 
 		 522 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.08 
 
 		 478 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.98 
 
 		 763 aa  226  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.08 
 
 		 484 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.69 
 
 		 452 aa  226  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.28 
 
 		 478 aa  226  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.06 
 
 		 480 aa  226  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.21 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.01 
 
 		 505 aa  225  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.32 
 
 		 508 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.99 
 
 		 478 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.92 
 
 		 520 aa  225  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.89 
 
 		 527 aa  224  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.65 
 
 		 487 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.45 
 
 		 469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.27 
 
 		 520 aa  221  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.73 
 
 		 486 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.24 
 
 		 504 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.1 
 
 		 534 aa  220  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 468 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 468 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.41 
 
 		 486 aa  216  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.41 
 
 		 486 aa  216  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.41 
 
 		 486 aa  216  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.65 
 
 		 485 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.75 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 523 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0761  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.37 
 
 		 534 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.698382  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.73 
 
 		 512 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.41 
 
 		 486 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.41 
 
 		 486 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.41 
 
 		 486 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.12 
 
 		 525 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.23 
 
 		 534 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.47 
 
 		 493 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.44 
 
 		 509 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.09 
 
 		 498 aa  213  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.41 
 
 		 540 aa  212  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 397 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.82 
 
 		 487 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  36.39 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.15 
 
 		 472 aa  211  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 		 520 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.95 
 
 		 488 aa  210  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_4907  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 477 aa  209  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.000355174 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.23 
 
 		 521 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1879  major facilitator family transporter  36.75 
 
 		 511 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  36.28 
 
 		 487 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0465  major facilitator superfamily permease  36.38 
 
 		 511 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
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NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 483 aa  208  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
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NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.34 
 
 		 475 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.73 
 
 		 458 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0562  major facilitator superfamily permease  36.12 
 
 		 514 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 		 463 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.5 
 
 		 466 aa  206  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
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NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.41 
 
 		 626 aa  206  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
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