More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2305 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 613 aa  1164    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3231  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.47 
 
 		 479 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.79 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.82 
 
 		 502 aa  355  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.05 
 
 		 492 aa  355  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.69 
 
 		 529 aa  352  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1801  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.85 
 
 		 504 aa  348  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0797811  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.34 
 
 		 498 aa  343  8e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.19 
 
 		 500 aa  340  5e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.9 
 
 		 489 aa  333  8e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.09 
 
 		 500 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.87 
 
 		 486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  45.27 
 
 		 457 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.91 
 
 		 539 aa  282  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.56 
 
 		 542 aa  277  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.69 
 
 		 483 aa  276  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.57 
 
 		 583 aa  272  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.09 
 
 		 516 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4620  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.78 
 
 		 470 aa  256  9e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.82 
 
 		 520 aa  254  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1524  major facilitator superfamily MFS_1  38.85 
 
 		 546 aa  243  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.565851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  41.24 
 
 		 465 aa  241  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0976  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.39 
 
 		 537 aa  237  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  37.37 
 
 		 467 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.25 
 
 		 522 aa  233  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2240  major facilitator superfamily MFS_1  41.86 
 
 		 463 aa  226  9e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0215877  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.76 
 
 		 502 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.2 
 
 		 528 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.27 
 
 		 763 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.23 
 
 		 498 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.19 
 
 		 504 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.55 
 
 		 485 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.28 
 
 		 478 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.95 
 
 		 510 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.66 
 
 		 487 aa  207  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.03 
 
 		 478 aa  206  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.34 
 
 		 469 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.52 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 		 463 aa  204  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.2 
 
 		 480 aa  203  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  39.46 
 
 		 523 aa  203  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.1 
 
 		 452 aa  202  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.85 
 
 		 489 aa  202  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 494 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.04 
 
 		 532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.82 
 
 		 488 aa  199  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0982  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.75 
 
 		 497 aa  198  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  36.66 
 
 		 469 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1879  major facilitator family transporter  35.88 
 
 		 511 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0465  major facilitator superfamily permease  35.88 
 
 		 511 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1425  putative methylenomycin A resistance protein  35.88 
 
 		 511 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.91 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2189  putative methylenomycin A resistance protein  35.88 
 
 		 511 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.969114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 463 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0562  major facilitator superfamily permease  35.66 
 
 		 514 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.12 
 
 		 486 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.24 
 
 		 520 aa  193  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 		 478 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.35 
 
 		 472 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.34 
 
 		 490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.03 
 
 		 520 aa  191  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.67 
 
 		 512 aa  190  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  37.78 
 
 		 497 aa  190  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 		 478 aa  190  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.49 
 
 		 505 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.41 
 
 		 475 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.14 
 
 		 788 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.26 
 
 		 534 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.97 
 
 		 522 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.05 
 
 		 469 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.51 
 
 		 466 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.67 
 
 		 487 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  31.19 
 
 		 534 aa  187  7e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.2 
 
 		 527 aa  186  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.87 
 
 		 458 aa  186  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.93 
 
 		 540 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.11 
 
 		 458 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 483 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.04 
 
 		 458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.88 
 
 		 524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.31 
 
 		 490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.25 
 
 		 519 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 518 aa  184  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.09 
 
 		 489 aa  184  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.1 
 
 		 488 aa  184  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0921  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 455 aa  184  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224208  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0971  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.25 
 
 		 475 aa  184  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.51 
 
 		 478 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
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NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.85 
 
 		 525 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
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NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
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NC_007948  Bpro_1215  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.13 
 
 		 477 aa  181  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.842605 
 
 
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