More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3692 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  100 
 
 		 479 aa  911    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4907  major facilitator transporter  83.09 
 
 		 477 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.000355174 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  89.42 
 
 		 482 aa  694    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  99.79 
 
 		 488 aa  909    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  99.79 
 
 		 488 aa  909    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  73.67 
 
 		 523 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  70.38 
 
 		 494 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1879  major facilitator family transporter  59.65 
 
 		 511 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0562  major facilitator superfamily permease  59.3 
 
 		 514 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0465  major facilitator superfamily permease  59.45 
 
 		 511 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1425  putative methylenomycin A resistance protein  59.45 
 
 		 511 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2189  putative methylenomycin A resistance protein  59.45 
 
 		 511 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.969114  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2073  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  59.16 
 
 		 561 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132683  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0921  major facilitator transporter  51.97 
 
 		 455 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224208  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  46.39 
 
 		 480 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  45.45 
 
 		 469 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  47.32 
 
 		 483 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  47.32 
 
 		 483 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  45.85 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  45.74 
 
 		 463 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.79 
 
 		 452 aa  293  5e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  45.12 
 
 		 468 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  45.12 
 
 		 468 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  41.52 
 
 		 457 aa  260  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  43.92 
 
 		 468 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.19 
 
 		 478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  41.46 
 
 		 474 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.7 
 
 		 480 aa  253  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.33 
 
 		 478 aa  251  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.66 
 
 		 484 aa  250  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.66 
 
 		 478 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.42 
 
 		 478 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0408  major facilitator superfamily MFS_1  43.81 
 
 		 487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.417643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.18 
 
 		 522 aa  243  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.05 
 
 		 488 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  41.25 
 
 		 450 aa  239  6.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.69 
 
 		 490 aa  234  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  38.39 
 
 		 483 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.16 
 
 		 502 aa  232  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.24 
 
 		 458 aa  230  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40 
 
 		 485 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 469 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.9 
 
 		 505 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.41 
 
 		 498 aa  224  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.41 
 
 		 458 aa  223  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.6 
 
 		 763 aa  223  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.15 
 
 		 508 aa  222  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 		 486 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.8 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 		 486 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 		 486 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.57 
 
 		 524 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.1 
 
 		 478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.77 
 
 		 506 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.77 
 
 		 506 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.26 
 
 		 506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.35 
 
 		 510 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 476 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.91 
 
 		 525 aa  210  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.92 
 
 		 478 aa  210  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.59 
 
 		 489 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.8 
 
 		 534 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.71 
 
 		 502 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47230  putative MFS transporter  39.16 
 
 		 513 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.55 
 
 		 516 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.12 
 
 		 492 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4075  MFS family transporter  39.34 
 
 		 513 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118331  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.4 
 
 		 503 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.88 
 
 		 506 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1215  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.08 
 
 		 477 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.31 
 
 		 519 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.84 
 
 		 466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.38 
 
 		 489 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.58 
 
 		 500 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 		 520 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.09 
 
 		 500 aa  196  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.84 
 
 		 532 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.49 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6246  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 465 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 507 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3387  major facilitator transporter  40.74 
 
 		 465 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.19 
 
 		 532 aa  192  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  36.63 
 
 		 537 aa  192  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 		 529 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6648  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 465 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.86 
 
 		 522 aa  190  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.7 
 
 		 522 aa  190  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  37.18 
 
 		 489 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.41 
 
 		 469 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  34.31 
 
 		 523 aa  189  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 515 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0353  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.9 
 
 		 511 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1585  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.72 
 
 		 487 aa  187  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>