More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0921 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



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Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0921  major facilitator transporter  100 
 
 
455 aa  860    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224208  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1425  putative methylenomycin A resistance protein  48.85 
 
 
511 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2189  putative methylenomycin A resistance protein  48.85 
 
 
511 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.969114  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0465  major facilitator superfamily permease  49.48 
 
 
511 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1879  major facilitator family transporter  49.48 
 
 
511 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0562  major facilitator superfamily permease  49.17 
 
 
514 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  53.07 
 
 
523 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2073  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  48.52 
 
 
561 aa  349  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132683  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  53.79 
 
 
479 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  53.55 
 
 
488 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  53.55 
 
 
488 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  52.67 
 
 
482 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4907  major facilitator transporter  52.55 
 
 
477 aa  332  8e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.000355174 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  51.38 
 
 
494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  44.71 
 
 
480 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  44.83 
 
 
469 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  44.47 
 
 
483 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  44.47 
 
 
483 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  43.21 
 
 
463 aa  276  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.41 
 
 
452 aa  272  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 
463 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  43 
 
 
468 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  43 
 
 
468 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  39.82 
 
 
457 aa  246  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.39 
 
 
522 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  41.37 
 
 
474 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  42.11 
 
 
468 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  42.7 
 
 
397 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0408  major facilitator superfamily MFS_1  43.47 
 
 
487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.417643 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.74 
 
 
478 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.28 
 
 
478 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.8 
 
 
484 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.8 
 
 
478 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 
483 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.68 
 
 
478 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  42.68 
 
 
469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.12 
 
 
502 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.47 
 
 
485 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 
486 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 
486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 
486 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 
486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 
486 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 
486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.29 
 
 
478 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.67 
 
 
469 aa  213  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.18 
 
 
505 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.5 
 
 
529 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.75 
 
 
458 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  42.01 
 
 
476 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.11 
 
 
763 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.33 
 
 
500 aa  209  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.8 
 
 
492 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 
534 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  42.01 
 
 
476 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  42.01 
 
 
476 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.46 
 
 
516 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.1 
 
 
487 aa  206  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.57 
 
 
510 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.75 
 
 
525 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.96 
 
 
532 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.88 
 
 
583 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.25 
 
 
471 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  39.2 
 
 
457 aa  203  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.16 
 
 
478 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.47 
 
 
524 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2892  major facilitator transporter  37.47 
 
 
477 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.89 
 
 
490 aa  201  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.44 
 
 
480 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.62 
 
 
500 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.3 
 
 
520 aa  200  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  39.45 
 
 
450 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.74 
 
 
542 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.29 
 
 
508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  35.21 
 
 
467 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.68 
 
 
519 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.1 
 
 
540 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.76 
 
 
458 aa  196  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.77 
 
 
476 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.8 
 
 
502 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.07 
 
 
532 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.86 
 
 
488 aa  194  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.62 
 
 
527 aa  193  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.5 
 
 
474 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.46 
 
 
498 aa  193  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.94 
 
 
522 aa  193  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  37.56 
 
 
492 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.9 
 
 
539 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.07 
 
 
504 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
504 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.62 
 
 
613 aa  191  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.38 
 
 
486 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  34.94 
 
 
497 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 
520 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
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NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.57 
 
 
529 aa  190  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.66 
 
 
528 aa  190  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
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NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.46 
 
 
458 aa  190  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
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NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.77 
 
 
520 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
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NC_012848  Rleg_5075  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 
453 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550975  normal  0.411558 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.78 
 
 
489 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
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