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for query gene Bcenmc03_6246 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6246  major facilitator transporter  100 
 
 		 465 aa  879    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3387  major facilitator transporter  95.27 
 
 		 465 aa  713    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6648  major facilitator transporter  98.71 
 
 		 465 aa  865    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 463 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.8 
 
 		 452 aa  253  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  41.28 
 
 		 468 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  41.28 
 
 		 468 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  40.6 
 
 		 483 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 469 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 463 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 476 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 476 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 476 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  39.44 
 
 		 469 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  40 
 
 		 523 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  41 
 
 		 397 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 479 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 		 494 aa  222  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4907  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 477 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.000355174 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  41.27 
 
 		 468 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 482 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 474 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  40.39 
 
 		 480 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 483 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 483 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.98 
 
 		 502 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.74 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  36.98 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.17 
 
 		 540 aa  208  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.7 
 
 		 480 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.62 
 
 		 504 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.45 
 
 		 505 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.91 
 
 		 522 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.54 
 
 		 489 aa  199  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  35.23 
 
 		 467 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0562  major facilitator superfamily permease  36.83 
 
 		 514 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.27 
 
 		 458 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.61 
 
 		 508 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1879  major facilitator family transporter  36.85 
 
 		 511 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0465  major facilitator superfamily permease  36.85 
 
 		 511 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.52 
 
 		 498 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1425  putative methylenomycin A resistance protein  36.85 
 
 		 511 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2189  putative methylenomycin A resistance protein  36.85 
 
 		 511 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.969114  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.98 
 
 		 478 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35 
 
 		 486 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35 
 
 		 486 aa  192  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.15 
 
 		 534 aa  192  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35 
 
 		 486 aa  192  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 		 506 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.5 
 
 		 486 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.21 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.5 
 
 		 486 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.5 
 
 		 486 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 		 506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 		 506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.21 
 
 		 484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.37 
 
 		 478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2073  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  37.33 
 
 		 561 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132683  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.19 
 
 		 490 aa  190  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.12 
 
 		 458 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.82 
 
 		 489 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.02 
 
 		 506 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.84 
 
 		 510 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1215  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.07 
 
 		 477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.52 
 
 		 520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.65 
 
 		 485 aa  183  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0408  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 		 487 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.417643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.92 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0921  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224208  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.85 
 
 		 478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.15 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.2 
 
 		 529 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.55 
 
 		 500 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.08 
 
 		 505 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.56 
 
 		 546 aa  176  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 		 514 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.08 
 
 		 627 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.29 
 
 		 488 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.55 
 
 		 500 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.23 
 
 		 478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.75 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.81 
 
 		 492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.64 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.93 
 
 		 502 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.2 
 
 		 474 aa  173  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.18 
 
 		 524 aa  173  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.01 
 
 		 468 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.76 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.55 
 
 		 515 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.54 
 
 		 539 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.77 
 
 		 520 aa  170  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 		 646 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 		 646 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.26 
 
 		 763 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
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NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.52 
 
 		 528 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.49 
 
 		 487 aa  169  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
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NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 646 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
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