More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47230 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4075  MFS family transporter  95.32 
 
 		 513 aa  785    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47230  putative MFS transporter  100 
 
 		 513 aa  973    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  60.04 
 
 		 490 aa  485  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.77 
 
 		 505 aa  477  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.62 
 
 		 506 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.66 
 
 		 506 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.66 
 
 		 506 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.45 
 
 		 506 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.5 
 
 		 458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  39.9 
 
 		 469 aa  256  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.73 
 
 		 489 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.75 
 
 		 480 aa  239  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.92 
 
 		 522 aa  229  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 483 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 		 463 aa  226  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.54 
 
 		 522 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 463 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 488 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 488 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 479 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.77 
 
 		 452 aa  220  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.87 
 
 		 478 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.65 
 
 		 502 aa  219  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.41 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  37.68 
 
 		 450 aa  218  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.41 
 
 		 478 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 468 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 468 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.37 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 480 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.38 
 
 		 502 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.84 
 
 		 478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 494 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1425  putative methylenomycin A resistance protein  35.95 
 
 		 511 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 483 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 483 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2189  putative methylenomycin A resistance protein  35.95 
 
 		 511 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.969114  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1879  major facilitator family transporter  35.95 
 
 		 511 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 503 aa  213  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0465  major facilitator superfamily permease  35.95 
 
 		 511 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4907  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.000355174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.58 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 523 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0562  major facilitator superfamily permease  35.5 
 
 		 514 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  34.01 
 
 		 537 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.75 
 
 		 485 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 482 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 		 465 aa  209  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.3 
 
 		 487 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.2 
 
 		 532 aa  207  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.39 
 
 		 508 aa  206  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.05 
 
 		 539 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.57 
 
 		 510 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.41 
 
 		 478 aa  205  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.24 
 
 		 469 aa  204  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 528 aa  204  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0408  major facilitator superfamily MFS_1  38.63 
 
 		 487 aa  203  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.417643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.55 
 
 		 534 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2073  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  35.01 
 
 		 561 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132683  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.74 
 
 		 488 aa  202  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4620  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.24 
 
 		 470 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 		 507 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.39 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  36.82 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.36 
 
 		 527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.07 
 
 		 583 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.87 
 
 		 466 aa  196  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  38.82 
 
 		 457 aa  196  8.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.04 
 
 		 471 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.6 
 
 		 524 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.76 
 
 		 486 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.76 
 
 		 486 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.76 
 
 		 486 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.76 
 
 		 486 aa  193  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.76 
 
 		 486 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.76 
 
 		 486 aa  193  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 		 520 aa  193  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.23 
 
 		 515 aa  193  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 519 aa  193  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.29 
 
 		 545 aa  192  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  37.02 
 
 		 588 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 504 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  37.66 
 
 		 502 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.11 
 
 		 516 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1524  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 546 aa  190  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.565851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.42 
 
 		 525 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 397 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.59 
 
 		 525 aa  189  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.38 
 
 		 514 aa  190  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.07 
 
 		 621 aa  189  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.16 
 
 		 504 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.84 
 
 		 520 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.41 
 
 		 509 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.9 
 
 		 458 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  34.29 
 
 		 523 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.54 
 
 		 505 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.79 
 
 		 520 aa  187  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.16 
 
 		 504 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>