More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0124 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 471 aa  890    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.17 
 
 		 502 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.41 
 
 		 492 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3231  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.99 
 
 		 479 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.16 
 
 		 500 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.62 
 
 		 489 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.12 
 
 		 500 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.31 
 
 		 498 aa  383  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.79 
 
 		 613 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1801  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  56.88 
 
 		 504 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0797811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.32 
 
 		 529 aa  356  5.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.87 
 
 		 486 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.53 
 
 		 483 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  47.7 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.14 
 
 		 520 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.75 
 
 		 539 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  46.99 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.79 
 
 		 516 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.93 
 
 		 542 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2240  major facilitator superfamily MFS_1  46.34 
 
 		 463 aa  276  6e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0215877  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0976  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.12 
 
 		 537 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4620  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.77 
 
 		 470 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.63 
 
 		 522 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.86 
 
 		 583 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.81 
 
 		 478 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.17 
 
 		 498 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.99 
 
 		 478 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.75 
 
 		 484 aa  236  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.75 
 
 		 478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  39.19 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.26 
 
 		 489 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.88 
 
 		 487 aa  233  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 		 502 aa  233  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.73 
 
 		 524 aa  229  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1524  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 546 aa  229  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.565851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.4 
 
 		 478 aa  227  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.64 
 
 		 486 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.64 
 
 		 486 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.64 
 
 		 486 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.64 
 
 		 486 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.12 
 
 		 528 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.64 
 
 		 486 aa  226  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.64 
 
 		 486 aa  226  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 469 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.92 
 
 		 489 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.69 
 
 		 478 aa  224  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.39 
 
 		 504 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.48 
 
 		 468 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 523 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.07 
 
 		 510 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  40.19 
 
 		 483 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  34.17 
 
 		 534 aa  220  5e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.35 
 
 		 452 aa  220  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 482 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.21 
 
 		 469 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  42.47 
 
 		 479 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 476 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 488 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 488 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 476 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.95 
 
 		 485 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.14 
 
 		 478 aa  216  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.9 
 
 		 488 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 476 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  41.61 
 
 		 494 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 		 480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  38.83 
 
 		 468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  38.83 
 
 		 468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.16 
 
 		 522 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.67 
 
 		 519 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.34 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.99 
 
 		 532 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 		 463 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  40.39 
 
 		 466 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.39 
 
 		 520 aa  211  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.92 
 
 		 540 aa  210  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 520 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  38.37 
 
 		 463 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0982  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.09 
 
 		 497 aa  208  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.96 
 
 		 522 aa  207  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.32 
 
 		 529 aa  206  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.41 
 
 		 516 aa  207  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.9 
 
 		 493 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.59 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.29 
 
 		 534 aa  204  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4907  major facilitator transporter  42.01 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.000355174 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  40.17 
 
 		 397 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1879  major facilitator family transporter  38.62 
 
 		 511 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0465  major facilitator superfamily permease  38.62 
 
 		 511 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.12 
 
 		 490 aa  203  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
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NC_006349  BMAA1425  putative methylenomycin A resistance protein  38.62 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  37.47 
 
 		 492 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
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NC_008835  BMA10229_2189  putative methylenomycin A resistance protein  38.62 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.969114  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 507 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.32 
 
 		 488 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.53 
 
 		 487 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
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NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.8 
 
 		 474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.71 
 
 		 520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0562  major facilitator superfamily permease  38.36 
 
 		 514 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.86 
 
 		 487 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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