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for query gene BMAA1425 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1425  putative methylenomycin A resistance protein  100 
 
 
511 aa  982    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1879  major facilitator family transporter  99.8 
 
 
511 aa  978    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2073  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  84.85 
 
 
561 aa  738    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132683  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2189  putative methylenomycin A resistance protein  100 
 
 
511 aa  982    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.969114  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0562  major facilitator superfamily permease  98.44 
 
 
514 aa  899    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0465  major facilitator superfamily permease  99.41 
 
 
511 aa  976    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  61.34 
 
 
494 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  62.72 
 
 
523 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  60.12 
 
 
482 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4907  major facilitator transporter  60.94 
 
 
477 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.000355174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  59.63 
 
 
488 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  59.63 
 
 
488 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  60.46 
 
 
479 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0921  major facilitator transporter  48.85 
 
 
455 aa  332  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224208  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  41.56 
 
 
469 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.5 
 
 
452 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  43.2 
 
 
480 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  43.43 
 
 
483 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  43.43 
 
 
483 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  39.96 
 
 
463 aa  276  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  39.87 
 
 
463 aa  265  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  38.95 
 
 
468 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  38.95 
 
 
468 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 
457 aa  248  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  38.74 
 
 
468 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 
483 aa  237  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0408  major facilitator superfamily MFS_1  40.13 
 
 
487 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.417643 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  37.38 
 
 
397 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  38.41 
 
 
474 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  37.78 
 
 
450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.94 
 
 
522 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.53 
 
 
458 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.93 
 
 
505 aa  216  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.39 
 
 
488 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.21 
 
 
478 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.21 
 
 
484 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.69 
 
 
478 aa  210  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.99 
 
 
478 aa  210  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.95 
 
 
763 aa  209  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.27 
 
 
458 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.46 
 
 
480 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.96 
 
 
502 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.67 
 
 
490 aa  206  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.19 
 
 
478 aa  204  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.13 
 
 
485 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.3 
 
 
524 aa  204  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.55 
 
 
478 aa  202  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.78 
 
 
500 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.19 
 
 
500 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.88 
 
 
471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.99 
 
 
492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.07 
 
 
510 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.4 
 
 
522 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.35 
 
 
502 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.47 
 
 
532 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  35.63 
 
 
469 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.88 
 
 
613 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.5 
 
 
534 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.47 
 
 
506 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.05 
 
 
466 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.13 
 
 
506 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 
486 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.13 
 
 
506 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 
486 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 
486 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 
486 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.33 
 
 
506 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2508  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 
472 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.58745  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 
486 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 
486 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.03 
 
 
525 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5075  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
453 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550975  normal  0.411558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.75 
 
 
498 aa  186  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.25 
 
 
478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.04 
 
 
508 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.78 
 
 
489 aa  183  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.11 
 
 
504 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.01 
 
 
532 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.96 
 
 
504 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.96 
 
 
504 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.96 
 
 
519 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.12 
 
 
487 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.81 
 
 
509 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  31.76 
 
 
467 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.74 
 
 
504 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.33 
 
 
583 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.42 
 
 
476 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  31.7 
 
 
523 aa  179  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.74 
 
 
504 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3231  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.76 
 
 
479 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.89 
 
 
540 aa  178  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.58 
 
 
504 aa  178  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.39 
 
 
626 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.06 
 
 
528 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1455  major facilitator transporter  34.62 
 
 
443 aa  177  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47230  putative MFS transporter  34.57 
 
 
513 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.52 
 
 
504 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.52 
 
 
504 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.39 
 
 
493 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.05 
 
 
469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
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