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for query gene Bcen_5301 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



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Plasmid clonability

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  98.66 
 
 
397 aa  701    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  88.91 
 
 
468 aa  708    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  100 
 
 
468 aa  883    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  100 
 
 
468 aa  883    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.74 
 
 
452 aa  467  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  54.5 
 
 
463 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  50.44 
 
 
463 aa  401  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  45.74 
 
 
469 aa  296  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  42.24 
 
 
457 aa  280  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  44.87 
 
 
523 aa  280  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  42.79 
 
 
480 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  43.36 
 
 
494 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  44.58 
 
 
482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.63 
 
 
478 aa  266  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  42.26 
 
 
483 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  42.26 
 
 
483 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.76 
 
 
522 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4907  major facilitator transporter  44.55 
 
 
477 aa  261  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.000355174 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  44.42 
 
 
479 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1879  major facilitator family transporter  38.32 
 
 
511 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0465  major facilitator superfamily permease  38.32 
 
 
511 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2073  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  40.13 
 
 
561 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132683  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0562  major facilitator superfamily permease  38.68 
 
 
514 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1425  putative methylenomycin A resistance protein  38.32 
 
 
511 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2189  putative methylenomycin A resistance protein  38.32 
 
 
511 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.969114  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  44.17 
 
 
488 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  44.17 
 
 
488 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  43.1 
 
 
474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  41.12 
 
 
483 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.24 
 
 
485 aa  252  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.38 
 
 
478 aa  252  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.11 
 
 
502 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  42.24 
 
 
469 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.74 
 
 
478 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.74 
 
 
478 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.86 
 
 
508 aa  245  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.74 
 
 
484 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.07 
 
 
480 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.81 
 
 
489 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.47 
 
 
486 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.47 
 
 
486 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.47 
 
 
486 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.47 
 
 
486 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.47 
 
 
486 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.47 
 
 
486 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.56 
 
 
478 aa  236  7e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  41.26 
 
 
476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  41.5 
 
 
476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  41.5 
 
 
476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0921  major facilitator transporter  42.86 
 
 
455 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224208  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.6 
 
 
488 aa  230  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.88 
 
 
505 aa  229  8e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.19 
 
 
458 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.93 
 
 
505 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2892  major facilitator transporter  39.01 
 
 
477 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.19 
 
 
489 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.86 
 
 
520 aa  221  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.13 
 
 
763 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.58 
 
 
540 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.15 
 
 
466 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.92 
 
 
510 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.65 
 
 
478 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  36.39 
 
 
537 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.25 
 
 
534 aa  213  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.76 
 
 
502 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1585  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 
492 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.61 
 
 
524 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0408  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 
487 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.417643 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5226  major facilitator transporter  37.88 
 
 
478 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39196  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.56 
 
 
469 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.32 
 
 
458 aa  207  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.73 
 
 
506 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  35.14 
 
 
523 aa  206  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.87 
 
 
504 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 
646 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 
646 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 
646 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.81 
 
 
474 aa  203  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1455  major facilitator transporter  37.28 
 
 
443 aa  203  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.94 
 
 
520 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.53 
 
 
506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.53 
 
 
506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.16 
 
 
506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.92 
 
 
490 aa  200  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.71 
 
 
522 aa  200  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5842  major facilitator transporter  35.08 
 
 
456 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6246  major facilitator transporter  40.85 
 
 
465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307812  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4168  major facilitator transporter  37.29 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.55276  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.52 
 
 
476 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.83 
 
 
528 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
607 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.07 
 
 
471 aa  196  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  35.73 
 
 
528 aa  196  9e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  37.5 
 
 
450 aa  195  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.44 
 
 
531 aa  193  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6648  major facilitator transporter  39.14 
 
 
465 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.8 
 
 
529 aa  194  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
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NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.41 
 
 
627 aa  193  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
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NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.32 
 
 
488 aa  192  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.8 
 
 
493 aa  192  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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