More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0906 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 510 aa  973    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.86 
 
 		 488 aa  472  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.02 
 
 		 489 aa  420  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0971  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.93 
 
 		 475 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.64 
 
 		 486 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.98 
 
 		 468 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.7 
 
 		 504 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  45.1 
 
 		 467 aa  352  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.27 
 
 		 478 aa  340  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3502  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.1 
 
 		 474 aa  341  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.11 
 
 		 472 aa  331  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1215  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.99 
 
 		 477 aa  293  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.91 
 
 		 522 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.5 
 
 		 478 aa  276  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.83 
 
 		 489 aa  269  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.76 
 
 		 480 aa  263  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.71 
 
 		 522 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.54 
 
 		 540 aa  259  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.76 
 
 		 534 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.28 
 
 		 469 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.53 
 
 		 502 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.51 
 
 		 522 aa  251  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.91 
 
 		 528 aa  247  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  38.5 
 
 		 530 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 		 532 aa  243  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  38.29 
 
 		 528 aa  242  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.43 
 
 		 527 aa  240  5.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.28 
 
 		 509 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.56 
 
 		 508 aa  236  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.04 
 
 		 520 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.11 
 
 		 763 aa  232  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.42 
 
 		 546 aa  232  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.15 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.99 
 
 		 646 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.99 
 
 		 646 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.8 
 
 		 520 aa  231  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.75 
 
 		 646 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.3 
 
 		 512 aa  230  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.02 
 
 		 476 aa  227  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.89 
 
 		 502 aa  226  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.3 
 
 		 516 aa  226  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 463 aa  226  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.34 
 
 		 583 aa  226  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.71 
 
 		 458 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.16 
 
 		 458 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.75 
 
 		 516 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36 
 
 		 609 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.43 
 
 		 529 aa  224  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.81 
 
 		 498 aa  224  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.83 
 
 		 524 aa  223  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.79 
 
 		 492 aa  223  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.52 
 
 		 524 aa  223  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.83 
 
 		 452 aa  223  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4620  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.04 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.27 
 
 		 534 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.77 
 
 		 529 aa  220  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.65 
 
 		 500 aa  220  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.32 
 
 		 505 aa  219  7.999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.7 
 
 		 542 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  35.53 
 
 		 492 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  37.56 
 
 		 457 aa  217  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.71 
 
 		 579 aa  216  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.93 
 
 		 469 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.26 
 
 		 511 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.84 
 
 		 532 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.24 
 
 		 520 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 463 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.11 
 
 		 493 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  38.01 
 
 		 465 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.04 
 
 		 539 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.9 
 
 		 519 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.69 
 
 		 505 aa  213  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.92 
 
 		 478 aa  213  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.34 
 
 		 607 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.76 
 
 		 527 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  33.75 
 
 		 579 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.68 
 
 		 478 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 		 484 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1524  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 546 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.565851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.64 
 
 		 500 aa  210  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  34.06 
 
 		 470 aa  210  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.09 
 
 		 579 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 519 aa  209  9e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  34.91 
 
 		 537 aa  209  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 509 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.01 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.99 
 
 		 485 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.94 
 
 		 514 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 		 520 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.12 
 
 		 498 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.71 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.18 
 
 		 503 aa  207  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
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NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.18 
 
 		 627 aa  207  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.8 
 
 		 521 aa  207  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
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NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 490 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
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NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.53 
 
 		 489 aa  206  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
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NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.65 
 
 		 525 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 494 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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