More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3686 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 546 aa  1051    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
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NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  65.52 
 
 		 534 aa  625  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  66.79 
 
 		 540 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.84 
 
 		 512 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.16 
 
 		 509 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.61 
 
 		 505 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.42 
 
 		 493 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.35 
 
 		 511 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.78 
 
 		 521 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.27 
 
 		 646 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.27 
 
 		 646 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.05 
 
 		 646 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.42 
 
 		 609 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.34 
 
 		 627 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  44.52 
 
 		 579 aa  365  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.47 
 
 		 494 aa  357  3.9999999999999996e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.36 
 
 		 504 aa  337  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.55 
 
 		 579 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.36 
 
 		 522 aa  284  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 		 790 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.38 
 
 		 528 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
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NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.42 
 
 		 510 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.06 
 
 		 488 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.51 
 
 		 522 aa  230  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.89 
 
 		 504 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0971  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.64 
 
 		 475 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.85 
 
 		 478 aa  223  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
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NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.45 
 
 		 474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.98 
 
 		 489 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.5 
 
 		 487 aa  220  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
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NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  32.2 
 
 		 530 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.99 
 
 		 498 aa  214  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.86 
 
 		 515 aa  212  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
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NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  36.17 
 
 		 467 aa  212  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.81 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.34 
 
 		 502 aa  210  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 		 485 aa  209  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.45 
 
 		 514 aa  209  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.71 
 
 		 541 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
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NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.31 
 
 		 478 aa  208  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.17 
 
 		 529 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.52 
 
 		 541 aa  206  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.73 
 
 		 522 aa  206  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 514 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.02 
 
 		 579 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.26 
 
 		 583 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 		 524 aa  203  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.32 
 
 		 489 aa  203  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
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NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  36.86 
 
 		 469 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.81 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
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NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.33 
 
 		 551 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
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NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.6 
 
 		 520 aa  201  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 520 aa  200  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.69 
 
 		 763 aa  200  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
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NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.95 
 
 		 564 aa  200  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.55 
 
 		 539 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.84 
 
 		 475 aa  199  9e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.64 
 
 		 520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.29 
 
 		 520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.45 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.05 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.48 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.45 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.91 
 
 		 585 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.5 
 
 		 526 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.86 
 
 		 484 aa  198  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.95 
 
 		 521 aa  197  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.78 
 
 		 478 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.78 
 
 		 478 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 520 aa  197  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 520 aa  197  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 		 477 aa  196  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 520 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  30.19 
 
 		 512 aa  196  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 490 aa  196  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  28.05 
 
 		 582 aa  196  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 520 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 		 534 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.88 
 
 		 520 aa  196  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.59 
 
 		 520 aa  196  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 520 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.24 
 
 		 458 aa  196  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.98 
 
 		 472 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  27.82 
 
 		 582 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 470 aa  195  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  28.28 
 
 		 582 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.36 
 
 		 530 aa  195  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.79 
 
 		 553 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.53 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.53 
 
 		 520 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.77 
 
 		 523 aa  193  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.87 
 
 		 458 aa  193  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  29.95 
 
 		 512 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.2 
 
 		 487 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.76 
 
 		 621 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  29.95 
 
 		 512 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
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NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 486 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.77 
 
 		 520 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 486 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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