More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2622 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 790 aa  1519    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.79 
 
 		 509 aa  330  7e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.58 
 
 		 512 aa  323  6e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.66 
 
 		 609 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.51 
 
 		 493 aa  308  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.98 
 
 		 627 aa  308  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.79 
 
 		 646 aa  305  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.79 
 
 		 646 aa  305  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.55 
 
 		 646 aa  303  9e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.27 
 
 		 505 aa  301  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.95 
 
 		 511 aa  282  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.43 
 
 		 521 aa  281  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  40.43 
 
 		 579 aa  277  6e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.75 
 
 		 540 aa  272  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.42 
 
 		 494 aa  268  4e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.23 
 
 		 534 aa  261  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.38 
 
 		 504 aa  257  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.13 
 
 		 546 aa  255  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.69 
 
 		 529 aa  181  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.31 
 
 		 522 aa  179  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.48 
 
 		 478 aa  178  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.13 
 
 		 579 aa  178  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 483 aa  177  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 469 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.79 
 
 		 522 aa  174  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 528 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.52 
 
 		 452 aa  170  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.31 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.65 
 
 		 478 aa  170  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0925  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.02 
 
 		 173 aa  166  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000199253  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 503 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.62 
 
 		 478 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.45 
 
 		 478 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.45 
 
 		 484 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.95 
 
 		 466 aa  163  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.37 
 
 		 458 aa  163  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  34.79 
 
 		 480 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 		 480 aa  162  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.89 
 
 		 478 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.65 
 
 		 478 aa  162  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.05 
 
 		 579 aa  161  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  32.53 
 
 		 530 aa  161  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 		 564 aa  160  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.9 
 
 		 522 aa  160  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 477 aa  160  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  33.96 
 
 		 497 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 		 483 aa  158  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.26 
 
 		 520 aa  157  7e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.62 
 
 		 502 aa  157  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.46 
 
 		 567 aa  157  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 463 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 463 aa  156  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 		 457 aa  156  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 		 520 aa  156  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 532 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 508 aa  156  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 468 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 468 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.14 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.25 
 
 		 488 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 506 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.02 
 
 		 486 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.02 
 
 		 486 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.02 
 
 		 486 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.85 
 
 		 506 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.28 
 
 		 486 aa  154  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.28 
 
 		 486 aa  154  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.28 
 
 		 486 aa  154  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 504 aa  154  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.17 
 
 		 541 aa  153  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 		 514 aa  153  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.93 
 
 		 456 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.63 
 
 		 458 aa  152  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.02 
 
 		 506 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.02 
 
 		 506 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.95 
 
 		 524 aa  152  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.04 
 
 		 583 aa  151  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.73 
 
 		 469 aa  151  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 470 aa  150  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10248  oxidoreductase  53.59 
 
 		 162 aa  150  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.712736 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 523 aa  151  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.85 
 
 		 484 aa  151  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.35 
 
 		 522 aa  150  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.94 
 
 		 531 aa  150  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
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NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  33.49 
 
 		 450 aa  150  9e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  31.24 
 
 		 471 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.38 
 
 		 475 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.89 
 
 		 514 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 		 505 aa  150  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.27 
 
 		 545 aa  150  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.07 
 
 		 498 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.58 
 
 		 520 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_6465  transporter  32.66 
 
 		 484 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
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NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.44 
 
 		 527 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.65 
 
 		 621 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 471 aa  149  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
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NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.92 
 
 		 528 aa  148  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.68 
 
 		 485 aa  148  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
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NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.04 
 
 		 592 aa  148  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.71 
 
 		 502 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
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