More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3532 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 480 aa  911    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  58.93 
 
 		 471 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  49.69 
 
 		 524 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  50.63 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  53.35 
 
 		 490 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  52.57 
 
 		 477 aa  349  5e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  48.04 
 
 		 481 aa  345  7e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  47.33 
 
 		 481 aa  341  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  49.68 
 
 		 504 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  43.15 
 
 		 479 aa  332  9e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.4 
 
 		 527 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  45.59 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  48.64 
 
 		 473 aa  325  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  42.32 
 
 		 476 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.27 
 
 		 500 aa  312  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  44.58 
 
 		 479 aa  306  6e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  44.37 
 
 		 481 aa  296  8e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21380  arabinose efflux permease family protein  39.58 
 
 		 481 aa  284  3.0000000000000004e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000069815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 485 aa  279  8e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2921  major facilitator transporter  38.25 
 
 		 485 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  39.17 
 
 		 477 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.52 
 
 		 583 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4533  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 481 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  35.59 
 
 		 480 aa  246  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 555 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 480 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 492 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 471 aa  236  7e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  36.93 
 
 		 492 aa  236  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 		 488 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 		 484 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.97 
 
 		 481 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4112  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 493 aa  229  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.965802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 473 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.55 
 
 		 502 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 		 528 aa  227  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  33.4 
 
 		 493 aa  226  9e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 		 471 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2716  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 505 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  36.32 
 
 		 484 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  39.06 
 
 		 503 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 630 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 		 509 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 		 488 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 480 aa  223  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2348  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720535  normal  0.469317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 486 aa  219  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  34.47 
 
 		 483 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 518 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 494 aa  217  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2231  major facilitator transporter  37.09 
 
 		 470 aa  216  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.68 
 
 		 564 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04730  arabinose efflux permease family protein  40.28 
 
 		 529 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4881  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  33.63 
 
 		 516 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 514 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 514 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 486 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 		 487 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 505 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 471 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 516 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 470 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.3 
 
 		 493 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 		 513 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 486 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 486 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 486 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  38.23 
 
 		 505 aa  192  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.66 
 
 		 456 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 493 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 484 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 493 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 493 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  34.54 
 
 		 488 aa  186  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 484 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.71 
 
 		 763 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0290  major facilitator superfamily MFS_1  38.66 
 
 		 535 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.344355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 491 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 487 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 512 aa  181  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.19 
 
 		 522 aa  180  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1065  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 475 aa  179  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1069  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 		 476 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2701  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 		 503 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417248  normal  0.482514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2727  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 		 480 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.66 
 
 		 627 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.8 
 
 		 540 aa  177  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.76 
 
 		 534 aa  177  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.85 
 
 		 487 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.91 
 
 		 528 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.78 
 
 		 521 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.78 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.98 
 
 		 529 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.11 
 
 		 478 aa  172  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.6 
 
 		 505 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>