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for query gene Tbis_2687 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 466 aa  904    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  62.28 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  57.75 
 
 		 485 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.43 
 
 		 478 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.43 
 
 		 478 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.43 
 
 		 484 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.39 
 
 		 488 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.35 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.68 
 
 		 478 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.84 
 
 		 486 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.84 
 
 		 486 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.84 
 
 		 486 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.84 
 
 		 486 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.84 
 
 		 486 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.84 
 
 		 486 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.22 
 
 		 478 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.9 
 
 		 508 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5461  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5860  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.16 
 
 		 480 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.81 
 
 		 522 aa  267  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.2 
 
 		 458 aa  260  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.7 
 
 		 489 aa  252  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.79 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.52 
 
 		 522 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.22 
 
 		 534 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 		 520 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  37.71 
 
 		 463 aa  233  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.42 
 
 		 478 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.49 
 
 		 487 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.6 
 
 		 525 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.41 
 
 		 520 aa  229  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.36 
 
 		 502 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.38 
 
 		 538 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.04 
 
 		 503 aa  225  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.56 
 
 		 498 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  37.13 
 
 		 469 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 457 aa  223  6e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.6 
 
 		 763 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.8 
 
 		 519 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.21 
 
 		 531 aa  219  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.63 
 
 		 478 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.15 
 
 		 528 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  38.59 
 
 		 450 aa  217  4e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  36.14 
 
 		 537 aa  217  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.43 
 
 		 522 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  36.84 
 
 		 469 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.14 
 
 		 520 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.03 
 
 		 505 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  35.76 
 
 		 468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.1 
 
 		 532 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.7 
 
 		 490 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.99 
 
 		 500 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 480 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.1 
 
 		 527 aa  210  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.32 
 
 		 478 aa  210  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  35.32 
 
 		 467 aa  209  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.18 
 
 		 507 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 528 aa  210  6e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.77 
 
 		 522 aa  209  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  37.01 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.54 
 
 		 471 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.45 
 
 		 487 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.24 
 
 		 489 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 483 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 483 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3231  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.72 
 
 		 479 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.39 
 
 		 469 aa  206  9e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 519 aa  206  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.41 
 
 		 490 aa  206  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.38 
 
 		 524 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.05 
 
 		 506 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.72 
 
 		 626 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.09 
 
 		 501 aa  205  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  35.44 
 
 		 530 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.96 
 
 		 500 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 523 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 		 483 aa  203  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.47 
 
 		 553 aa  202  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.22 
 
 		 527 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.07 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.32 
 
 		 468 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.32 
 
 		 506 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.4 
 
 		 532 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.71 
 
 		 496 aa  200  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.49 
 
 		 521 aa  200  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.52 
 
 		 540 aa  199  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.44 
 
 		 487 aa  199  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 		 516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.8 
 
 		 506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.8 
 
 		 506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.93 
 
 		 474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.85 
 
 		 512 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 503 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
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NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.2 
 
 		 519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
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NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.16 
 
 		 607 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
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