More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1052 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  65.98 
 
 		 501 aa  639    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 496 aa  979    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  66.46 
 
 		 495 aa  631  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.99 
 
 		 497 aa  501  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0354  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase alpha and beta subunits-like protein  50.74 
 
 		 484 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 462 aa  261  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  36.28 
 
 		 470 aa  251  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.74 
 
 		 474 aa  249  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.9 
 
 		 464 aa  246  9e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.462732  normal  0.495513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.97 
 
 		 475 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.02 
 
 		 474 aa  236  8e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.8 
 
 		 475 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.48 
 
 		 456 aa  228  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.21 
 
 		 477 aa  226  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.6 
 
 		 480 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0059  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 478 aa  224  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.976428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.8 
 
 		 478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 		 493 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 		 477 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.75 
 
 		 461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.11 
 
 		 512 aa  217  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.65 
 
 		 534 aa  216  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.93 
 
 		 579 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 		 522 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 		 514 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.91 
 
 		 540 aa  212  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.26 
 
 		 482 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  35.47 
 
 		 492 aa  211  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.86 
 
 		 465 aa  210  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.07 
 
 		 478 aa  210  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.9 
 
 		 558 aa  209  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.41 
 
 		 521 aa  209  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.87 
 
 		 500 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.6 
 
 		 545 aa  205  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
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NC_007796  Mhun_2030  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 474 aa  204  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.275978  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  30.66 
 
 		 462 aa  203  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.84 
 
 		 509 aa  202  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
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NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.12 
 
 		 528 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 482 aa  200  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 487 aa  200  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
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NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.14 
 
 		 502 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.05 
 
 		 477 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 		 482 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.42 
 
 		 488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 		 493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.43 
 
 		 484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
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NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.13 
 
 		 697 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
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NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.1 
 
 		 685 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.81 
 
 		 505 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.51 
 
 		 478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.31 
 
 		 487 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.64 
 
 		 678 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.99 
 
 		 475 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.3 
 
 		 483 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.06 
 
 		 539 aa  193  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
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NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 		 522 aa  193  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.35 
 
 		 538 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.38 
 
 		 494 aa  191  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.9 
 
 		 484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.1 
 
 		 483 aa  191  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 		 486 aa  190  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 		 498 aa  190  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.95 
 
 		 524 aa  190  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.94 
 
 		 538 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.41 
 
 		 524 aa  189  8e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 460 aa  189  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.92 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0761  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.63 
 
 		 534 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.698382  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1566  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 483 aa  188  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.59 
 
 		 520 aa  188  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.32 
 
 		 685 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  31.2 
 
 		 465 aa  187  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1015  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 498 aa  187  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.817522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.9 
 
 		 521 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.39 
 
 		 529 aa  187  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.15 
 
 		 485 aa  187  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.67 
 
 		 511 aa  186  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.53 
 
 		 592 aa  186  8e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 		 478 aa  186  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  30.53 
 
 		 537 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  30.53 
 
 		 537 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.71 
 
 		 466 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
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NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.93 
 
 		 542 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
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NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.82 
 
 		 504 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.77 
 
 		 513 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_1287  hypothetical protein  39.54 
 
 		 459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.188212 
 
 
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NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.77 
 
 		 513 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  31.08 
 
 		 537 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
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NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  31.08 
 
 		 476 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  31.08 
 
 		 537 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  31.08 
 
 		 537 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  31.08 
 
 		 537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.1 
 
 		 480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.3 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  28.94 
 
 		 458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.3 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
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