More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3698 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
483 aa  924    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  51.26 
 
 
500 aa  456  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.72 
 
 
477 aa  344  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.83 
 
 
477 aa  336  7e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.23 
 
 
475 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.37 
 
 
474 aa  318  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.39 
 
 
478 aa  312  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.12 
 
 
493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.46 
 
 
456 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.17 
 
 
465 aa  266  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.92 
 
 
475 aa  264  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  35.76 
 
 
476 aa  263  4.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  33.7 
 
 
466 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.69 
 
 
477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.9 
 
 
461 aa  254  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  35.7 
 
 
510 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.6 
 
 
482 aa  248  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  34.67 
 
 
503 aa  248  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  35.95 
 
 
462 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.85 
 
 
482 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.45 
 
 
478 aa  239  9e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.08 
 
 
482 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1318  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 
474 aa  236  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.6 
 
 
522 aa  235  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  34.35 
 
 
455 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  34.35 
 
 
455 aa  232  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  34.35 
 
 
455 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.12 
 
 
484 aa  231  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 
491 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.76 
 
 
486 aa  227  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  34.21 
 
 
480 aa  220  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  32.53 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  32.29 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  32.29 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  32.53 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  32.77 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  32.29 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  32.29 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  32.29 
 
 
457 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.47 
 
 
483 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  34.28 
 
 
458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.71 
 
 
457 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.48 
 
 
457 aa  213  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.48 
 
 
457 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.48 
 
 
457 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.48 
 
 
457 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.48 
 
 
457 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.09 
 
 
457 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  31.01 
 
 
463 aa  209  9e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  31.18 
 
 
455 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  32.25 
 
 
457 aa  208  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.51 
 
 
474 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  31.54 
 
 
457 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.68 
 
 
482 aa  207  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2367  major facilitator transporter  33.11 
 
 
478 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  31.48 
 
 
455 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  31.48 
 
 
455 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0923  major facilitator transporter  33.73 
 
 
459 aa  206  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  31.71 
 
 
473 aa  206  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.42 
 
 
496 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.03 
 
 
501 aa  205  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 
464 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  31.18 
 
 
455 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  31.18 
 
 
455 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  32.49 
 
 
475 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  30.86 
 
 
479 aa  204  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  29.34 
 
 
488 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.59 
 
 
512 aa  203  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  31.18 
 
 
455 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  32.99 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.36 
 
 
463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  33.25 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  32.36 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  34.48 
 
 
426 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 
528 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.1 
 
 
495 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.66 
 
 
478 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.94 
 
 
455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 
460 aa  200  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 
455 aa  200  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  34.63 
 
 
466 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1601  major facilitator transporter  31.54 
 
 
488 aa  199  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.15 
 
 
478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  32.84 
 
 
467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.59 
 
 
534 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.15 
 
 
484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 
445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.79 
 
 
511 aa  198  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2004  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 
476 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0685608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  31.26 
 
 
455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1309  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 
455 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.42 
 
 
474 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.93 
 
 
579 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  33.07 
 
 
492 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  31.48 
 
 
498 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  32.68 
 
 
461 aa  197  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  31.11 
 
 
474 aa  197  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 
462 aa  197  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.74 
 
 
522 aa  196  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>