More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1107 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  99.12 
 
 
457 aa  874    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  99.12 
 
 
457 aa  874    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  99.56 
 
 
457 aa  876    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  99.12 
 
 
457 aa  874    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  83.26 
 
 
455 aa  726    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  83.74 
 
 
455 aa  721    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  93.42 
 
 
457 aa  814    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  83.04 
 
 
455 aa  745    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  99.12 
 
 
457 aa  874    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  75.51 
 
 
474 aa  665    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  83.52 
 
 
455 aa  728    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1140  major facilitator superfamily MFS_1  75.11 
 
 
485 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  100 
 
 
457 aa  880    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  83.04 
 
 
455 aa  745    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  99.34 
 
 
457 aa  875    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  81.98 
 
 
455 aa  719    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  83.52 
 
 
455 aa  728    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  73.77 
 
 
480 aa  608  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  61.95 
 
 
455 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  61.95 
 
 
455 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  61.95 
 
 
455 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  63.31 
 
 
480 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  60.36 
 
 
457 aa  520  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  60.31 
 
 
474 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  57.24 
 
 
457 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  57.46 
 
 
457 aa  491  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  57.46 
 
 
457 aa  491  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  57.46 
 
 
457 aa  491  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  57.24 
 
 
457 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  57.24 
 
 
457 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  57.46 
 
 
457 aa  491  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  57.46 
 
 
457 aa  491  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  57.02 
 
 
457 aa  487  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  57.92 
 
 
445 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  55.01 
 
 
464 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  54.99 
 
 
475 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  55.13 
 
 
488 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0923  major facilitator transporter  56.12 
 
 
459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1309  major facilitator superfamily MFS_1  56.76 
 
 
455 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  55.84 
 
 
455 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  55.84 
 
 
455 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  50.34 
 
 
464 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  53.35 
 
 
473 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  51.01 
 
 
459 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  53.24 
 
 
466 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  53.62 
 
 
476 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  54.09 
 
 
498 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  51.02 
 
 
442 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  54.32 
 
 
491 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  54.65 
 
 
453 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  54.65 
 
 
453 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  54.09 
 
 
472 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1703  major facilitator superfamily transporter  52.19 
 
 
468 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2000  major facilitator superfamily MFS_1  52.41 
 
 
468 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0919237  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50 
 
 
459 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  53.42 
 
 
459 aa  418  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  54.32 
 
 
497 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  52.31 
 
 
446 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2896  major facilitator superfamily MFS_1  53.7 
 
 
476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17584  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3366  major facilitator transporter  50.22 
 
 
474 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209391  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4661  major facilitator transporter  54.87 
 
 
468 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3129  major facilitator transporter  55.64 
 
 
459 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0660329 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  51.09 
 
 
490 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  55.16 
 
 
459 aa  388  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1868  major facilitator superfamily transporter  51.3 
 
 
463 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210947  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3110  major facilitator superfamily MFS_1  48 
 
 
469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.54 
 
 
463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04823  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  43.39 
 
 
479 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05653  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  43.39 
 
 
479 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  40.41 
 
 
461 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6200  major facilitator superfamily MFS_1  46.71 
 
 
481 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.7 
 
 
475 aa  233  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.28 
 
 
477 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.31 
 
 
477 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.6 
 
 
474 aa  219  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.23 
 
 
493 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.11 
 
 
465 aa  210  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.89 
 
 
500 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.53 
 
 
482 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.48 
 
 
483 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  34.78 
 
 
416 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.57 
 
 
461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  32.76 
 
 
462 aa  195  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.66 
 
 
456 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.86 
 
 
482 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.59 
 
 
483 aa  187  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.37 
 
 
482 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 
475 aa  187  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.45 
 
 
482 aa  186  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 
477 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.2 
 
 
486 aa  180  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 
504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.93 
 
 
528 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.51 
 
 
478 aa  170  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.14 
 
 
478 aa  170  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.84 
 
 
489 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.68 
 
 
514 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  30.82 
 
 
492 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.56 
 
 
501 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.34 
 
 
488 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>