More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2121 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  73.56 
 
 		 457 aa  656    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  73.78 
 
 		 457 aa  657    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  73.78 
 
 		 457 aa  657    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  73.78 
 
 		 457 aa  657    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  75.83 
 
 		 457 aa  666    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  73.78 
 
 		 457 aa  657    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  80.85 
 
 		 455 aa  719    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  73.56 
 
 		 457 aa  655    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  100 
 
 		 480 aa  941    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  80.85 
 
 		 455 aa  719    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  73.72 
 
 		 457 aa  653    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  73.56 
 
 		 457 aa  656    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  80.85 
 
 		 455 aa  719    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  73.78 
 
 		 457 aa  657    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  68.39 
 
 		 445 aa  597  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  67.49 
 
 		 464 aa  590  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  63.76 
 
 		 474 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  61.78 
 
 		 455 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  61.78 
 
 		 455 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  62.11 
 
 		 455 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  61.78 
 
 		 455 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1140  major facilitator superfamily MFS_1  62.99 
 
 		 485 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.44 
 
 		 457 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  63.92 
 
 		 457 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.44 
 
 		 457 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  63.68 
 
 		 457 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  62.42 
 
 		 457 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.44 
 
 		 457 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.44 
 
 		 457 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  61.78 
 
 		 455 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  61.78 
 
 		 455 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.44 
 
 		 457 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  58.55 
 
 		 474 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  61.78 
 
 		 455 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  60.18 
 
 		 480 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  56 
 
 		 459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  56.25 
 
 		 475 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0923  major facilitator transporter  55.61 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  53.12 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2896  major facilitator superfamily MFS_1  54.65 
 
 		 476 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17584  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3129  major facilitator transporter  58.37 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0660329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  57.89 
 
 		 459 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2000  major facilitator superfamily MFS_1  52.85 
 
 		 468 aa  422  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0919237  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  50.43 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1309  major facilitator superfamily MFS_1  54.85 
 
 		 455 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3366  major facilitator transporter  51.74 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  50.68 
 
 		 488 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1703  major facilitator superfamily transporter  52.63 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  50.56 
 
 		 459 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  52.73 
 
 		 455 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  50.22 
 
 		 498 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  51.45 
 
 		 455 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.88 
 
 		 459 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  50.34 
 
 		 491 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  51.47 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  50.11 
 
 		 442 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  51.92 
 
 		 473 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  50.34 
 
 		 472 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  50.66 
 
 		 466 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  50.8 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  50.8 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  50.98 
 
 		 490 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  50.45 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1868  major facilitator superfamily transporter  52.98 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4661  major facilitator transporter  51.67 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3110  major facilitator superfamily MFS_1  45.95 
 
 		 469 aa  349  5e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04823  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  42.18 
 
 		 479 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05653  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  42.18 
 
 		 479 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.31 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6200  major facilitator superfamily MFS_1  45.84 
 
 		 481 aa  298  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  42.38 
 
 		 461 aa  297  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.82 
 
 		 475 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.63 
 
 		 474 aa  234  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.34 
 
 		 477 aa  226  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.61 
 
 		 477 aa  226  9e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 493 aa  223  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.21 
 
 		 483 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.5 
 
 		 456 aa  213  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.93 
 
 		 482 aa  206  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.6 
 
 		 500 aa  202  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.88 
 
 		 483 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  33.25 
 
 		 462 aa  201  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.35 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.66 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.78 
 
 		 461 aa  196  8.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.87 
 
 		 482 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.14 
 
 		 482 aa  187  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.05 
 
 		 486 aa  183  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.83 
 
 		 477 aa  181  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.03 
 
 		 482 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.13 
 
 		 478 aa  177  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 		 512 aa  177  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.69 
 
 		 502 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  32.74 
 
 		 510 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.28 
 
 		 505 aa  173  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 503 aa  174  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.64 
 
 		 509 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1601  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 488 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 416 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>