More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3647 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
445 aa  868    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  79.5 
 
 
464 aa  697    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  66.89 
 
 
455 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  66.89 
 
 
455 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  66.89 
 
 
455 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  68.39 
 
 
480 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  65.77 
 
 
457 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  66 
 
 
457 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  65.77 
 
 
457 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  66 
 
 
457 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  66 
 
 
457 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  66 
 
 
457 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  66 
 
 
457 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  66.59 
 
 
457 aa  560  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  65.77 
 
 
457 aa  560  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  65.91 
 
 
457 aa  555  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  58.31 
 
 
474 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  57.73 
 
 
455 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  57.73 
 
 
455 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  59.28 
 
 
480 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1140  major facilitator superfamily MFS_1  59.05 
 
 
485 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  57.72 
 
 
455 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59 
 
 
457 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  58.19 
 
 
455 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.62 
 
 
457 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  57.86 
 
 
457 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  57.86 
 
 
457 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.62 
 
 
457 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  57.96 
 
 
455 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  57.96 
 
 
455 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.62 
 
 
457 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.62 
 
 
457 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.62 
 
 
457 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  56.5 
 
 
474 aa  458  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  57.96 
 
 
455 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  52.62 
 
 
455 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  53.35 
 
 
475 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  51.71 
 
 
455 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  50.11 
 
 
488 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2896  major facilitator superfamily MFS_1  55.85 
 
 
476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17584  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  53.72 
 
 
459 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  52.31 
 
 
464 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2000  major facilitator superfamily MFS_1  52.65 
 
 
468 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0919237  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  51.4 
 
 
459 aa  398  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  51.4 
 
 
442 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  51.48 
 
 
498 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.4 
 
 
459 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3366  major facilitator transporter  52.12 
 
 
474 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209391  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1703  major facilitator superfamily transporter  52.43 
 
 
468 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  49.88 
 
 
446 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  51.61 
 
 
453 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  51.61 
 
 
453 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  51.48 
 
 
472 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  50.8 
 
 
476 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  50.91 
 
 
491 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0923  major facilitator transporter  52.64 
 
 
459 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  49.51 
 
 
473 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3129  major facilitator transporter  55 
 
 
459 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0660329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  54.5 
 
 
459 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1309  major facilitator superfamily MFS_1  52.41 
 
 
455 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  49.66 
 
 
466 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  51.36 
 
 
497 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  49.14 
 
 
490 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1868  major facilitator superfamily transporter  52.2 
 
 
463 aa  364  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210947  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4661  major facilitator transporter  52.11 
 
 
468 aa  352  8e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3110  major facilitator superfamily MFS_1  43.92 
 
 
469 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04823  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  43.19 
 
 
479 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05653  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  43.19 
 
 
479 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.34 
 
 
463 aa  286  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  41.81 
 
 
461 aa  277  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6200  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 
481 aa  262  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.16 
 
 
475 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.95 
 
 
474 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.69 
 
 
493 aa  223  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.89 
 
 
477 aa  209  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.57 
 
 
477 aa  209  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.52 
 
 
482 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.74 
 
 
456 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.59 
 
 
461 aa  194  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.78 
 
 
512 aa  193  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.36 
 
 
483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.86 
 
 
509 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.92 
 
 
483 aa  188  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  33.73 
 
 
416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.66 
 
 
465 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  31.08 
 
 
462 aa  180  4e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.59 
 
 
482 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  31.17 
 
 
462 aa  178  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.18 
 
 
609 aa  176  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.01 
 
 
496 aa  176  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.11 
 
 
477 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.15 
 
 
482 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.31 
 
 
475 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 
500 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  30.07 
 
 
467 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.75 
 
 
482 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.68 
 
 
484 aa  171  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1601  major facilitator transporter  32.87 
 
 
488 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.01 
 
 
646 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 
501 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>