More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05653 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS04823  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  100 
 
 		 479 aa  941    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05653  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  100 
 
 		 479 aa  941    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  47.61 
 
 		 476 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  45.93 
 
 		 488 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 446 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  47.27 
 
 		 455 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  47.05 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  45.09 
 
 		 464 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  46.15 
 
 		 490 aa  349  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  45.86 
 
 		 498 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 472 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  45.98 
 
 		 453 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  45.98 
 
 		 453 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  45.08 
 
 		 491 aa  342  8e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1140  major facilitator superfamily MFS_1  44.05 
 
 		 485 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  44.83 
 
 		 497 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  45.54 
 
 		 455 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  45.54 
 
 		 455 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  42.64 
 
 		 474 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 455 aa  330  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  44.04 
 
 		 455 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  45.32 
 
 		 473 aa  329  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.55 
 
 		 457 aa  329  7e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  43.76 
 
 		 455 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4661  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.8 
 
 		 457 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.8 
 
 		 457 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.8 
 
 		 457 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.8 
 
 		 457 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.8 
 
 		 457 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  44.8 
 
 		 457 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 480 aa  318  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  44.55 
 
 		 457 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  44.19 
 
 		 445 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  41.48 
 
 		 464 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 457 aa  307  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 475 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  39.16 
 
 		 474 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  39.91 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  40.79 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  40.79 
 
 		 457 aa  291  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  40.79 
 
 		 457 aa  291  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 457 aa  289  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 		 459 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 480 aa  286  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1309  major facilitator superfamily MFS_1  42.14 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  39.55 
 
 		 459 aa  282  8.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  40 
 
 		 442 aa  281  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0923  major facilitator transporter  42.21 
 
 		 459 aa  280  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.05 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3110  major facilitator superfamily MFS_1  38.85 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3129  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 459 aa  271  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0660329 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1703  major facilitator superfamily transporter  40.53 
 
 		 468 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  44.5 
 
 		 459 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2000  major facilitator superfamily MFS_1  40.53 
 
 		 468 aa  270  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0919237  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2896  major facilitator superfamily MFS_1  41.04 
 
 		 476 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17584  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3366  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 474 aa  239  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.95 
 
 		 463 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 461 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1868  major facilitator superfamily transporter  41.4 
 
 		 463 aa  228  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6200  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 		 481 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.83 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 		 474 aa  177  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.1 
 
 		 461 aa  176  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.23 
 
 		 500 aa  167  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26 
 
 		 475 aa  166  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.03 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.47 
 
 		 482 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.15 
 
 		 475 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.02 
 
 		 477 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.75 
 
 		 477 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.15 
 
 		 483 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.99 
 
 		 482 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  27.56 
 
 		 492 aa  151  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.71 
 
 		 484 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.9 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.5 
 
 		 478 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.12 
 
 		 456 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 476 aa  140  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 466 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.7 
 
 		 478 aa  138  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 470 aa  137  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.3 
 
 		 504 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.12 
 
 		 522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>