More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0096 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
477 aa  956    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.35 
 
 
493 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.19 
 
 
475 aa  392  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.98 
 
 
478 aa  385  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.5 
 
 
482 aa  331  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.09 
 
 
482 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  41.33 
 
 
458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.05 
 
 
475 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.26 
 
 
465 aa  274  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35 
 
 
474 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  36.66 
 
 
462 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.77 
 
 
477 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.13 
 
 
477 aa  249  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
482 aa  248  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.69 
 
 
483 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.87 
 
 
500 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.39 
 
 
461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.63 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.78 
 
 
487 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.55 
 
 
483 aa  216  9e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.68 
 
 
456 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
471 aa  212  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 
478 aa  202  8e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 
528 aa  200  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.05 
 
 
496 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.52 
 
 
478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 
501 aa  194  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  29.98 
 
 
473 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  27.54 
 
 
477 aa  192  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.69 
 
 
488 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  28.17 
 
 
470 aa  191  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.11 
 
 
495 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 
482 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 
460 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  29.03 
 
 
465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.99 
 
 
579 aa  189  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  28.79 
 
 
478 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 
476 aa  189  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  28.03 
 
 
503 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 
514 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  29.41 
 
 
470 aa  187  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.02 
 
 
474 aa  187  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  28.78 
 
 
465 aa  186  9e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.5 
 
 
502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  29.97 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  30.23 
 
 
457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  29.97 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  30.23 
 
 
457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.22 
 
 
534 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  30.23 
 
 
457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  30.23 
 
 
457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  30.23 
 
 
457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.39 
 
 
511 aa  184  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.47 
 
 
522 aa  184  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  28.61 
 
 
467 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.52 
 
 
478 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.98 
 
 
478 aa  183  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.56 
 
 
493 aa  183  7e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  27.25 
 
 
492 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.78 
 
 
522 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 
462 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 
478 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  28.77 
 
 
478 aa  182  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  28.54 
 
 
478 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.17 
 
 
457 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  29.72 
 
 
457 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 
478 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.52 
 
 
478 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.17 
 
 
457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.17 
 
 
457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.17 
 
 
457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.52 
 
 
484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.17 
 
 
457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.17 
 
 
457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.97 
 
 
520 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  27.62 
 
 
455 aa  180  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  27.62 
 
 
455 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  27.62 
 
 
455 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.02 
 
 
469 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.72 
 
 
479 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0049  major facilitator transporter  28.66 
 
 
560 aa  180  4.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.44 
 
 
505 aa  180  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  31.23 
 
 
467 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  28.9 
 
 
589 aa  179  7e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  29.79 
 
 
457 aa  179  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.51 
 
 
479 aa  179  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.66 
 
 
478 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.5 
 
 
512 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  28.19 
 
 
462 aa  178  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.48 
 
 
476 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.39 
 
 
472 aa  177  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  27.83 
 
 
464 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3485  multidrug efflux protein  28.47 
 
 
592 aa  177  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.160972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.11 
 
 
466 aa  177  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2197  major facilitator transporter  28.37 
 
 
596 aa  177  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.44 
 
 
509 aa  176  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.63 
 
 
545 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.24 
 
 
497 aa  176  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  29.09 
 
 
476 aa  176  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>