More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4542 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  85.55 
 
 		 446 aa  725    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 490 aa  954    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  72.75 
 
 		 455 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  74.04 
 
 		 455 aa  625  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  69.81 
 
 		 498 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  68.41 
 
 		 488 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  71.15 
 
 		 491 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  73.56 
 
 		 453 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  73.56 
 
 		 453 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  72 
 
 		 472 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  68.81 
 
 		 497 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4661  major facilitator transporter  70.67 
 
 		 468 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  58.33 
 
 		 464 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  56.87 
 
 		 476 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  50.76 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  52.25 
 
 		 455 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  52.25 
 
 		 455 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  51.72 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  51.49 
 
 		 457 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  51.49 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  51.49 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  51.49 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  51.49 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  51.49 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  51.49 
 
 		 457 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  51.49 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  50.89 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  51.58 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  51.34 
 
 		 455 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  51.34 
 
 		 455 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  49.33 
 
 		 480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  51.03 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  51.03 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  51.03 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  49.77 
 
 		 457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.72 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  51.45 
 
 		 455 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1140  major facilitator superfamily MFS_1  52.06 
 
 		 485 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.96 
 
 		 457 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  51.95 
 
 		 475 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.96 
 
 		 457 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  50.96 
 
 		 457 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.96 
 
 		 457 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.96 
 
 		 457 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  51 
 
 		 474 aa  398  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.96 
 
 		 457 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  51.2 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  51.18 
 
 		 464 aa  395  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  50.5 
 
 		 473 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  48.84 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  49.44 
 
 		 466 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  46.71 
 
 		 459 aa  372  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  47.71 
 
 		 442 aa  371  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  48.39 
 
 		 480 aa  369  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.83 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  49.31 
 
 		 459 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_003296  RS04823  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  44.62 
 
 		 479 aa  360  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05653  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  44.62 
 
 		 479 aa  360  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0923  major facilitator transporter  50.34 
 
 		 459 aa  352  7e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1309  major facilitator superfamily MFS_1  47.25 
 
 		 455 aa  345  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  50.98 
 
 		 459 aa  339  7e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3129  major facilitator transporter  50.98 
 
 		 459 aa  338  9e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0660329 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2000  major facilitator superfamily MFS_1  44.91 
 
 		 468 aa  325  9e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0919237  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1703  major facilitator superfamily transporter  44.69 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3110  major facilitator superfamily MFS_1  44.32 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3366  major facilitator transporter  43.23 
 
 		 474 aa  323  6e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2896  major facilitator superfamily MFS_1  45.92 
 
 		 476 aa  317  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17584  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1868  major facilitator superfamily transporter  43.9 
 
 		 463 aa  296  8e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 461 aa  293  5e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6200  major facilitator superfamily MFS_1  44.1 
 
 		 481 aa  277  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.96 
 
 		 463 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.54 
 
 		 475 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.66 
 
 		 474 aa  216  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 477 aa  214  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 477 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.55 
 
 		 493 aa  210  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.78 
 
 		 500 aa  197  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.89 
 
 		 483 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.28 
 
 		 482 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.18 
 
 		 482 aa  192  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 462 aa  190  4e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.18 
 
 		 467 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.08 
 
 		 475 aa  188  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.58 
 
 		 482 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.17 
 
 		 456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.76 
 
 		 477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.01 
 
 		 478 aa  182  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.74 
 
 		 505 aa  182  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  30.73 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.5 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 483 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.57 
 
 		 512 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.08 
 
 		 478 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  32 
 
 		 416 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 470 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.73 
 
 		 514 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.62 
 
 		 493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 		 486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.41 
 
 		 504 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>