More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2018 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  100 
 
 		 470 aa  919    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.37 
 
 		 472 aa  420  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.4 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.3 
 
 		 482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.6 
 
 		 482 aa  226  8e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34 
 
 		 475 aa  223  6e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.81 
 
 		 493 aa  223  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.79 
 
 		 478 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.1 
 
 		 475 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.66 
 
 		 493 aa  202  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  30.9 
 
 		 462 aa  200  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 		 477 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.9 
 
 		 474 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 465 aa  195  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.92 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.95 
 
 		 477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.84 
 
 		 483 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  30.22 
 
 		 458 aa  189  7e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.75 
 
 		 501 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  31.74 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  31.74 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  31.5 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  31.5 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 		 512 aa  187  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 461 aa  186  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 498 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.83 
 
 		 522 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 		 464 aa  183  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.15 
 
 		 455 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 497 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.52 
 
 		 496 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 491 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.17 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  32.76 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 455 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 476 aa  181  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  28.97 
 
 		 467 aa  179  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 446 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 457 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  30.77 
 
 		 464 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 453 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.27 
 
 		 504 aa  176  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 453 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 472 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.54 
 
 		 482 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 455 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 476 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.85 
 
 		 502 aa  173  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 455 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 455 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.6 
 
 		 511 aa  172  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 475 aa  172  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  30.6 
 
 		 459 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.54 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 497 aa  172  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  30.22 
 
 		 474 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.82 
 
 		 520 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 		 484 aa  172  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  30.68 
 
 		 442 aa  172  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.59 
 
 		 509 aa  171  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.66 
 
 		 478 aa  170  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.93 
 
 		 482 aa  170  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.33 
 
 		 459 aa  170  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 467 aa  170  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 459 aa  170  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 466 aa  169  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.73 
 
 		 585 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  29.58 
 
 		 582 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.02 
 
 		 474 aa  169  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.01 
 
 		 500 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.08 
 
 		 480 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  29.57 
 
 		 507 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  29.58 
 
 		 582 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.62 
 
 		 495 aa  168  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  28.07 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  29.75 
 
 		 507 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4661  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.73 
 
 		 529 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 		 486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.02 
 
 		 627 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.16 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  29.83 
 
 		 582 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.95 
 
 		 494 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  29.68 
 
 		 582 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.11 
 
 		 569 aa  166  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.54 
 
 		 534 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 461 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>